Protein–RNA interactions for Protein: P33947

KDELR2, ER lumen protein-retaining receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR2P33947 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
KDELR2P33947 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
KDELR2P33947 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
KDELR2P33947 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
KDELR2P33947 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
KDELR2P33947 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
KDELR2P33947 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
KDELR2P33947 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
KDELR2P33947 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
KDELR2P33947 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
KDELR2P33947 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
KDELR2P33947 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
KDELR2P33947 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
KDELR2P33947 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
KDELR2P33947 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
KDELR2P33947 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
KDELR2P33947 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
KDELR2P33947 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDELR2P33947 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
KDELR2P33947 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
KDELR2P33947 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KDELR2P33947 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KDELR2P33947 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KDELR2P33947 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KDELR2P33947 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KDELR2P33947 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KDELR2P33947 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
KDELR2P33947 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
KDELR2P33947 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
KDELR2P33947 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
KDELR2P33947 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KDELR2P33947 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KDELR2P33947 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KDELR2P33947 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
KDELR2P33947 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDELR2P33947 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KDELR2P33947 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KDELR2P33947 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KDELR2P33947 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KDELR2P33947 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KDELR2P33947 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KDELR2P33947 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KDELR2P33947 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
KDELR2P33947 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
KDELR2P33947 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KDELR2P33947 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KDELR2P33947 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDELR2P33947 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KDELR2P33947 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDELR2P33947 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
KDELR2P33947 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
KDELR2P33947 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
KDELR2P33947 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
KDELR2P33947 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
KDELR2P33947 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
KDELR2P33947 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
KDELR2P33947 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KDELR2P33947 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
KDELR2P33947 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDELR2P33947 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDELR2P33947 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDELR2P33947 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
KDELR2P33947 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
KDELR2P33947 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
KDELR2P33947 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
KDELR2P33947 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
KDELR2P33947 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
KDELR2P33947 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
KDELR2P33947 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
KDELR2P33947 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
KDELR2P33947 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
KDELR2P33947 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
KDELR2P33947 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
KDELR2P33947 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
KDELR2P33947 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
KDELR2P33947 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
KDELR2P33947 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
KDELR2P33947 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDELR2P33947 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDELR2P33947 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
KDELR2P33947 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KDELR2P33947 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KDELR2P33947 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KDELR2P33947 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KDELR2P33947 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KDELR2P33947 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDELR2P33947 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KDELR2P33947 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDELR2P33947 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
KDELR2P33947 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KDELR2P33947 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDELR2P33947 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDELR2P33947 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDELR2P33947 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
KDELR2P33947 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KDELR2P33947 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KDELR2P33947 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KDELR2P33947 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KDELR2P33947 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDELR2P33947 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms