Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC38.68■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC38.67■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.67■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.64■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC38.63■■■■□ 3.78
ABCC1P33527 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC38.62■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC38.58■■■■□ 3.77
ABCC1P33527 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.57■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC38.56■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC38.54■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC38.53■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.52■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
ABCC1P33527 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC38.5■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC38.49■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC38.48■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC38.46■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.45■■■■□ 3.75
ABCC1P33527 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.44■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC38.43■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC38.42■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC38.41■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.74
ABCC1P33527 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC1P33527 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC1P33527 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
ABCC1P33527 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC1P33527 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC1P33527 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC1P33527 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
ABCC1P33527 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC38.36■■■■□ 3.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms