Protein–RNA interactions for Protein: P32248

CCR7, C-C chemokine receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR7P32248 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR7P32248 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR7P32248 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR7P32248 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR7P32248 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR7P32248 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR7P32248 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCR7P32248 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR7P32248 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR7P32248 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR7P32248 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR7P32248 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCR7P32248 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR7P32248 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR7P32248 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR7P32248 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCR7P32248 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR7P32248 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR7P32248 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR7P32248 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCR7P32248 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR7P32248 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR7P32248 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR7P32248 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR7P32248 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCR7P32248 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CCR7P32248 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR7P32248 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCR7P32248 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCR7P32248 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR7P32248 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR7P32248 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR7P32248 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR7P32248 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR7P32248 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR7P32248 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCR7P32248 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR7P32248 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCR7P32248 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR7P32248 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR7P32248 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR7P32248 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR7P32248 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR7P32248 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCR7P32248 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCR7P32248 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR7P32248 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CCR7P32248 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR7P32248 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR7P32248 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR7P32248 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCR7P32248 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR7P32248 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR7P32248 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCR7P32248 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR7P32248 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR7P32248 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR7P32248 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR7P32248 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCR7P32248 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR7P32248 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR7P32248 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR7P32248 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR7P32248 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCR7P32248 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR7P32248 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR7P32248 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCR7P32248 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR7P32248 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCR7P32248 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR7P32248 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR7P32248 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCR7P32248 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR7P32248 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR7P32248 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR7P32248 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR7P32248 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR7P32248 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR7P32248 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCR7P32248 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR7P32248 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR7P32248 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR7P32248 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR7P32248 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR7P32248 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR7P32248 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR7P32248 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CCR7P32248 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR7P32248 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR7P32248 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR7P32248 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR7P32248 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR7P32248 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR7P32248 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCR7P32248 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR7P32248 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR7P32248 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR7P32248 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR7P32248 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCR7P32248 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms