Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
HOXA9P31269 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HOXA9P31269 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HOXA9P31269 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOXA9P31269 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms