Protein–RNA interactions for Protein: P30038

ALDH4A1, Delta-1-pyrroline-5-carboxylate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH4A1P30038 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH4A1P30038 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH4A1P30038 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH4A1P30038 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ALDH4A1P30038 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH4A1P30038 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH4A1P30038 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH4A1P30038 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH4A1P30038 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ALDH4A1P30038 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALDH4A1P30038 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ALDH4A1P30038 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ALDH4A1P30038 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ALDH4A1P30038 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ALDH4A1P30038 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ALDH4A1P30038 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.7 ms