Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHA3P29320 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPHA3P29320 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPHA3P29320 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPHA3P29320 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms