Protein–RNA interactions for Protein: P18846

ATF1, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-1, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF1P18846 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF1P18846 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF1P18846 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF1P18846 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATF1P18846 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATF1P18846 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF1P18846 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF1P18846 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATF1P18846 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF1P18846 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF1P18846 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF1P18846 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATF1P18846 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF1P18846 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF1P18846 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF1P18846 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF1P18846 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF1P18846 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATF1P18846 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF1P18846 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF1P18846 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATF1P18846 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF1P18846 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF1P18846 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF1P18846 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF1P18846 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF1P18846 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF1P18846 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATF1P18846 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATF1P18846 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF1P18846 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF1P18846 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF1P18846 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATF1P18846 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF1P18846 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF1P18846 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF1P18846 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF1P18846 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF1P18846 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF1P18846 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF1P18846 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ATF1P18846 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATF1P18846 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATF1P18846 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATF1P18846 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ATF1P18846 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF1P18846 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF1P18846 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF1P18846 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF1P18846 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF1P18846 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ATF1P18846 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATF1P18846 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATF1P18846 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATF1P18846 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ATF1P18846 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ATF1P18846 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATF1P18846 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATF1P18846 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ATF1P18846 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF1P18846 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF1P18846 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF1P18846 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF1P18846 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ATF1P18846 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF1P18846 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF1P18846 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF1P18846 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ATF1P18846 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF1P18846 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF1P18846 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF1P18846 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF1P18846 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF1P18846 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF1P18846 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ATF1P18846 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF1P18846 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF1P18846 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF1P18846 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF1P18846 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF1P18846 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF1P18846 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ATF1P18846 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF1P18846 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF1P18846 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF1P18846 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ATF1P18846 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF1P18846 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF1P18846 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF1P18846 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF1P18846 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ATF1P18846 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF1P18846 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF1P18846 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ATF1P18846 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATF1P18846 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATF1P18846 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ATF1P18846 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ATF1P18846 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ATF1P18846 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms