Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.3■■□□□ 1
EGR1P18146 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGR1P18146 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGR1P18146 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
EGR1P18146 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EGR1P18146 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EGR1P18146 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EGR1P18146 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
EGR1P18146 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EGR1P18146 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EGR1P18146 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
EGR1P18146 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.29■■□□□ 1
EGR1P18146 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
EGR1P18146 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
EGR1P18146 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
EGR1P18146 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
EGR1P18146 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
EGR1P18146 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EGR1P18146 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
EGR1P18146 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
EGR1P18146 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR1P18146 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR1P18146 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR1P18146 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR1P18146 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR1P18146 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
EGR1P18146 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGR1P18146 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGR1P18146 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
EGR1P18146 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
EGR1P18146 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGR1P18146 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGR1P18146 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
EGR1P18146 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGR1P18146 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
EGR1P18146 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR1P18146 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR1P18146 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR1P18146 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
EGR1P18146 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EGR1P18146 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EGR1P18146 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
EGR1P18146 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
EGR1P18146 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR1P18146 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR1P18146 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR1P18146 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR1P18146 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
EGR1P18146 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR1P18146 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR1P18146 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
EGR1P18146 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR1P18146 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR1P18146 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR1P18146 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR1P18146 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR1P18146 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR1P18146 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR1P18146 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR1P18146 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR1P18146 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR1P18146 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
EGR1P18146 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR1P18146 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR1P18146 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR1P18146 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR1P18146 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR1P18146 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
EGR1P18146 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EGR1P18146 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EGR1P18146 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EGR1P18146 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
EGR1P18146 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EGR1P18146 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EGR1P18146 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EGR1P18146 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EGR1P18146 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
EGR1P18146 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
EGR1P18146 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
EGR1P18146 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR1P18146 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR1P18146 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR1P18146 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR1P18146 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR1P18146 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
EGR1P18146 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR1P18146 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR1P18146 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR1P18146 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR1P18146 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR1P18146 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
EGR1P18146 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR1P18146 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR1P18146 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR1P18146 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR1P18146 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
EGR1P18146 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGR1P18146 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGR1P18146 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
EGR1P18146 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms