Protein–RNA interactions for Protein: P13521

SCG2, Secretogranin-2, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG2P13521 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SCG2P13521 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCG2P13521 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCG2P13521 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SCG2P13521 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SCG2P13521 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCG2P13521 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCG2P13521 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SCG2P13521 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCG2P13521 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
SCG2P13521 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SCG2P13521 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCG2P13521 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCG2P13521 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCG2P13521 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SCG2P13521 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SCG2P13521 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCG2P13521 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCG2P13521 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCG2P13521 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCG2P13521 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCG2P13521 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SCG2P13521 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCG2P13521 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
SCG2P13521 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SCG2P13521 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
SCG2P13521 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SCG2P13521 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCG2P13521 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SCG2P13521 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SCG2P13521 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCG2P13521 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCG2P13521 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCG2P13521 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCG2P13521 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCG2P13521 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SCG2P13521 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SCG2P13521 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCG2P13521 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCG2P13521 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SCG2P13521 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCG2P13521 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SCG2P13521 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCG2P13521 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCG2P13521 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCG2P13521 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCG2P13521 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCG2P13521 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SCG2P13521 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCG2P13521 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
SCG2P13521 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCG2P13521 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SCG2P13521 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SCG2P13521 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCG2P13521 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCG2P13521 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SCG2P13521 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
SCG2P13521 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SCG2P13521 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCG2P13521 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCG2P13521 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SCG2P13521 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SCG2P13521 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SCG2P13521 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCG2P13521 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCG2P13521 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SCG2P13521 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCG2P13521 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCG2P13521 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCG2P13521 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
SCG2P13521 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCG2P13521 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCG2P13521 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCG2P13521 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SCG2P13521 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCG2P13521 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SCG2P13521 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCG2P13521 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCG2P13521 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCG2P13521 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCG2P13521 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCG2P13521 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SCG2P13521 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCG2P13521 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SCG2P13521 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SCG2P13521 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SCG2P13521 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCG2P13521 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SCG2P13521 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
SCG2P13521 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCG2P13521 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCG2P13521 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCG2P13521 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCG2P13521 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCG2P13521 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SCG2P13521 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
SCG2P13521 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SCG2P13521 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCG2P13521 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SCG2P13521 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms