Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HOXD8P13378 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HOXD8P13378 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HOXD8P13378 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HOXD8P13378 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HOXD8P13378 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161 ms