Protein–RNA interactions for Protein: P11274

BCR, Breakpoint cluster region protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCRP11274 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
BCRP11274 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCRP11274 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCRP11274 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
BCRP11274 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCRP11274 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
BCRP11274 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCRP11274 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCRP11274 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCRP11274 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCRP11274 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
BCRP11274 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
BCRP11274 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCRP11274 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCRP11274 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCRP11274 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
BCRP11274 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
BCRP11274 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCRP11274 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCRP11274 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
BCRP11274 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCRP11274 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCRP11274 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
BCRP11274 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCRP11274 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCRP11274 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
BCRP11274 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCRP11274 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCRP11274 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
BCRP11274 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCRP11274 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCRP11274 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCRP11274 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
BCRP11274 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCRP11274 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCRP11274 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
BCRP11274 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
BCRP11274 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCRP11274 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
BCRP11274 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCRP11274 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCRP11274 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCRP11274 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
BCRP11274 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCRP11274 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCRP11274 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCRP11274 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
BCRP11274 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCRP11274 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCRP11274 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
BCRP11274 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCRP11274 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
BCRP11274 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCRP11274 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
BCRP11274 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCRP11274 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCRP11274 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCRP11274 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCRP11274 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
BCRP11274 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCRP11274 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCRP11274 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
BCRP11274 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
BCRP11274 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
BCRP11274 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCRP11274 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCRP11274 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCRP11274 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
BCRP11274 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCRP11274 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCRP11274 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCRP11274 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCRP11274 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCRP11274 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
BCRP11274 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
BCRP11274 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCRP11274 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCRP11274 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCRP11274 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
BCRP11274 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
BCRP11274 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCRP11274 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCRP11274 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCRP11274 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
BCRP11274 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCRP11274 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCRP11274 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
BCRP11274 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
BCRP11274 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
BCRP11274 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCRP11274 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
BCRP11274 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCRP11274 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCRP11274 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
BCRP11274 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCRP11274 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCRP11274 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCRP11274 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
BCRP11274 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
BCRP11274 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62 ms