Protein–RNA interactions for Protein: P10909

CLU, Clusterin, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUP10909 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CLUP10909 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLUP10909 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLUP10909 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLUP10909 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CLUP10909 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLUP10909 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLUP10909 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLUP10909 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLUP10909 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CLUP10909 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CLUP10909 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLUP10909 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLUP10909 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLUP10909 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLUP10909 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CLUP10909 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CLUP10909 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLUP10909 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLUP10909 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLUP10909 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLUP10909 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLUP10909 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLUP10909 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLUP10909 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CLUP10909 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CLUP10909 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLUP10909 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLUP10909 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CLUP10909 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLUP10909 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLUP10909 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLUP10909 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CLUP10909 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLUP10909 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CLUP10909 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLUP10909 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLUP10909 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLUP10909 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CLUP10909 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLUP10909 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLUP10909 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLUP10909 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLUP10909 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLUP10909 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLUP10909 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CLUP10909 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLUP10909 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLUP10909 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLUP10909 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CLUP10909 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLUP10909 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CLUP10909 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLUP10909 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLUP10909 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLUP10909 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLUP10909 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLUP10909 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CLUP10909 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CLUP10909 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLUP10909 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLUP10909 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLUP10909 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLUP10909 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CLUP10909 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLUP10909 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLUP10909 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLUP10909 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CLUP10909 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLUP10909 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLUP10909 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLUP10909 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLUP10909 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLUP10909 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLUP10909 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLUP10909 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLUP10909 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLUP10909 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLUP10909 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLUP10909 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLUP10909 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLUP10909 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLUP10909 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLUP10909 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLUP10909 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CLUP10909 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLUP10909 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLUP10909 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLUP10909 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLUP10909 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLUP10909 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLUP10909 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLUP10909 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLUP10909 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLUP10909 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLUP10909 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLUP10909 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLUP10909 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLUP10909 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLUP10909 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms