Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M6

IQCF3, IQ domain-containing protein F3, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCF3P0C7M6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
IQCF3P0C7M6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.08■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IQCF3P0C7M6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IQCF3P0C7M6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IQCF3P0C7M6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
IQCF3P0C7M6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQCF3P0C7M6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQCF3P0C7M6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQCF3P0C7M6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IQCF3P0C7M6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IQCF3P0C7M6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 573 ms