Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP3P08254 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP3P08254 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MMP3P08254 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP3P08254 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP3P08254 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP3P08254 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MMP3P08254 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP3P08254 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MMP3P08254 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP3P08254 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP3P08254 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP3P08254 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MMP3P08254 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MMP3P08254 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP3P08254 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP3P08254 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MMP3P08254 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP3P08254 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MMP3P08254 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP3P08254 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP3P08254 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MMP3P08254 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP3P08254 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP3P08254 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP3P08254 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP3P08254 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MMP3P08254 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP3P08254 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MMP3P08254 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP3P08254 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP3P08254 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP3P08254 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP3P08254 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP3P08254 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP3P08254 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MMP3P08254 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP3P08254 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MMP3P08254 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP3P08254 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP3P08254 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MMP3P08254 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP3P08254 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP3P08254 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MMP3P08254 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP3P08254 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MMP3P08254 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MMP3P08254 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP3P08254 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP3P08254 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP3P08254 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MMP3P08254 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP3P08254 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP3P08254 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP3P08254 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MMP3P08254 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
MMP3P08254 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MMP3P08254 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP3P08254 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP3P08254 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP3P08254 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MMP3P08254 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP3P08254 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP3P08254 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP3P08254 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP3P08254 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MMP3P08254 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP3P08254 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP3P08254 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP3P08254 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP3P08254 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP3P08254 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MMP3P08254 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP3P08254 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP3P08254 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP3P08254 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP3P08254 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP3P08254 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP3P08254 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP3P08254 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP3P08254 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MMP3P08254 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MMP3P08254 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP3P08254 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP3P08254 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP3P08254 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP3P08254 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MMP3P08254 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP3P08254 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP3P08254 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP3P08254 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP3P08254 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP3P08254 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MMP3P08254 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP3P08254 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP3P08254 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP3P08254 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MMP3P08254 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP3P08254 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MMP3P08254 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms