Protein–RNA interactions for Protein: P06753

TPM3, Tropomyosin alpha-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3P06753 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPM3P06753 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TPM3P06753 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM3P06753 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM3P06753 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TPM3P06753 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM3P06753 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM3P06753 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM3P06753 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM3P06753 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPM3P06753 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM3P06753 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM3P06753 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM3P06753 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM3P06753 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPM3P06753 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM3P06753 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM3P06753 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPM3P06753 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPM3P06753 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPM3P06753 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TPM3P06753 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPM3P06753 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM3P06753 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM3P06753 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPM3P06753 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM3P06753 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM3P06753 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM3P06753 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPM3P06753 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM3P06753 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM3P06753 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPM3P06753 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPM3P06753 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
TPM3P06753 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
TPM3P06753 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TPM3P06753 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM3P06753 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPM3P06753 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM3P06753 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM3P06753 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM3P06753 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM3P06753 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPM3P06753 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM3P06753 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM3P06753 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM3P06753 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM3P06753 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM3P06753 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPM3P06753 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
TPM3P06753 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPM3P06753 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPM3P06753 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPM3P06753 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPM3P06753 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPM3P06753 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM3P06753 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM3P06753 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM3P06753 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPM3P06753 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM3P06753 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPM3P06753 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM3P06753 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPM3P06753 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM3P06753 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM3P06753 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM3P06753 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM3P06753 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM3P06753 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM3P06753 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPM3P06753 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM3P06753 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM3P06753 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM3P06753 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TPM3P06753 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM3P06753 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM3P06753 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM3P06753 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TPM3P06753 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM3P06753 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM3P06753 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM3P06753 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM3P06753 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM3P06753 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM3P06753 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TPM3P06753 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TPM3P06753 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TPM3P06753 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM3P06753 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM3P06753 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TPM3P06753 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TPM3P06753 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPM3P06753 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPM3P06753 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPM3P06753 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TPM3P06753 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM3P06753 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM3P06753 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM3P06753 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TPM3P06753 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms