Protein–RNA interactions for Protein: P04433

IGKV3-11, Immunoglobulin kappa variable 3-11, humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV3-11P04433 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
IGKV3-11P04433 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
IGKV3-11P04433 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IGKV3-11P04433 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
IGKV3-11P04433 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms