Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTAP01040 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTAP01040 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSTAP01040 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTAP01040 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTAP01040 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CSTAP01040 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTAP01040 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTAP01040 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTAP01040 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSTAP01040 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTAP01040 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTAP01040 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTAP01040 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSTAP01040 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTAP01040 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTAP01040 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTAP01040 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSTAP01040 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSTAP01040 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSTAP01040 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTAP01040 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTAP01040 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTAP01040 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTAP01040 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTAP01040 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSTAP01040 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTAP01040 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTAP01040 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSTAP01040 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSTAP01040 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSTAP01040 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTAP01040 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTAP01040 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTAP01040 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTAP01040 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSTAP01040 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTAP01040 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTAP01040 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTAP01040 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTAP01040 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTAP01040 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSTAP01040 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSTAP01040 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSTAP01040 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSTAP01040 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSTAP01040 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSTAP01040 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSTAP01040 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSTAP01040 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSTAP01040 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTAP01040 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTAP01040 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSTAP01040 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTAP01040 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTAP01040 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTAP01040 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTAP01040 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTAP01040 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSTAP01040 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTAP01040 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTAP01040 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSTAP01040 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTAP01040 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTAP01040 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTAP01040 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSTAP01040 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CSTAP01040 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTAP01040 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTAP01040 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTAP01040 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTAP01040 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTAP01040 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTAP01040 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSTAP01040 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTAP01040 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTAP01040 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTAP01040 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTAP01040 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSTAP01040 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTAP01040 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTAP01040 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTAP01040 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTAP01040 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTAP01040 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTAP01040 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSTAP01040 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms