Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX11BO96011 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PEX11BO96011 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX11BO96011 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX11BO96011 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PEX11BO96011 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PEX11BO96011 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PEX11BO96011 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PEX11BO96011 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PEX11BO96011 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PEX11BO96011 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PEX11BO96011 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms