Protein–RNA interactions for Protein: O95273

CCNDBP1, Cyclin-D1-binding protein 1, humanhuman

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1O95273 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNDBP1O95273 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNDBP1O95273 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNDBP1O95273 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNDBP1O95273 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CCNDBP1O95273 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
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