Protein–RNA interactions for Protein: O60239

SH3BP5, SH3 domain-binding protein 5, humanhuman

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5O60239 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SH3BP5O60239 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SH3BP5O60239 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
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SH3BP5O60239 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SH3BP5O60239 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
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SH3BP5O60239 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
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SH3BP5O60239 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH3BP5O60239 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
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