Protein–RNA interactions for Protein: O60216

RAD21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD21O60216 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD21O60216 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
RAD21O60216 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD21O60216 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
RAD21O60216 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD21O60216 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD21O60216 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD21O60216 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
RAD21O60216 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD21O60216 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD21O60216 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD21O60216 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD21O60216 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD21O60216 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD21O60216 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD21O60216 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD21O60216 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RAD21O60216 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RAD21O60216 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD21O60216 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD21O60216 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD21O60216 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD21O60216 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD21O60216 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD21O60216 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD21O60216 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD21O60216 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD21O60216 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD21O60216 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD21O60216 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD21O60216 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD21O60216 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD21O60216 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD21O60216 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD21O60216 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD21O60216 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD21O60216 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD21O60216 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD21O60216 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAD21O60216 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAD21O60216 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
RAD21O60216 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAD21O60216 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
RAD21O60216 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAD21O60216 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
RAD21O60216 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD21O60216 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
RAD21O60216 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RAD21O60216 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD21O60216 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD21O60216 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
RAD21O60216 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD21O60216 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD21O60216 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD21O60216 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD21O60216 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD21O60216 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD21O60216 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RAD21O60216 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD21O60216 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD21O60216 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD21O60216 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD21O60216 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD21O60216 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
RAD21O60216 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD21O60216 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD21O60216 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
RAD21O60216 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RAD21O60216 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RAD21O60216 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
RAD21O60216 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RAD21O60216 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
RAD21O60216 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD21O60216 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD21O60216 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD21O60216 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD21O60216 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
RAD21O60216 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD21O60216 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD21O60216 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD21O60216 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RAD21O60216 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD21O60216 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD21O60216 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RAD21O60216 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD21O60216 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RAD21O60216 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD21O60216 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD21O60216 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD21O60216 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD21O60216 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD21O60216 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD21O60216 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
RAD21O60216 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD21O60216 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD21O60216 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD21O60216 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD21O60216 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD21O60216 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RAD21O60216 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms