Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ATP9BO43861 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ATP9BO43861 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ATP9BO43861 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATP9BO43861 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP9BO43861 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms