Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGTAO43765 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGTAO43765 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SGTAO43765 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SGTAO43765 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGTAO43765 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SGTAO43765 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGTAO43765 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SGTAO43765 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGTAO43765 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SGTAO43765 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGTAO43765 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGTAO43765 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SGTAO43765 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SGTAO43765 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGTAO43765 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SGTAO43765 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGTAO43765 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGTAO43765 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SGTAO43765 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGTAO43765 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGTAO43765 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SGTAO43765 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SGTAO43765 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SGTAO43765 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGTAO43765 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SGTAO43765 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGTAO43765 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SGTAO43765 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGTAO43765 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGTAO43765 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGTAO43765 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGTAO43765 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGTAO43765 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SGTAO43765 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGTAO43765 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGTAO43765 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGTAO43765 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SGTAO43765 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SGTAO43765 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SGTAO43765 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGTAO43765 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGTAO43765 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGTAO43765 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SGTAO43765 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGTAO43765 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGTAO43765 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SGTAO43765 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGTAO43765 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGTAO43765 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SGTAO43765 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SGTAO43765 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SGTAO43765 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SGTAO43765 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGTAO43765 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGTAO43765 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SGTAO43765 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGTAO43765 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGTAO43765 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGTAO43765 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SGTAO43765 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGTAO43765 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SGTAO43765 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGTAO43765 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGTAO43765 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGTAO43765 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SGTAO43765 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SGTAO43765 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGTAO43765 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SGTAO43765 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGTAO43765 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGTAO43765 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGTAO43765 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGTAO43765 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGTAO43765 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SGTAO43765 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SGTAO43765 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGTAO43765 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGTAO43765 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGTAO43765 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SGTAO43765 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGTAO43765 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGTAO43765 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SGTAO43765 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGTAO43765 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGTAO43765 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SGTAO43765 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
SGTAO43765 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGTAO43765 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGTAO43765 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGTAO43765 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SGTAO43765 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGTAO43765 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SGTAO43765 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SGTAO43765 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGTAO43765 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGTAO43765 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGTAO43765 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGTAO43765 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SGTAO43765 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms