Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LRRTM2O43300 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRTM2O43300 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LRRTM2O43300 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LRRTM2O43300 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LRRTM2O43300 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms