Protein–RNA interactions for Protein: O00499

BIN1, Myc box-dependent-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIN1O00499 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BIN1O00499 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
BIN1O00499 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
BIN1O00499 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BIN1O00499 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BIN1O00499 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BIN1O00499 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
BIN1O00499 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
BIN1O00499 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BIN1O00499 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
BIN1O00499 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
BIN1O00499 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
BIN1O00499 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BIN1O00499 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BIN1O00499 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
BIN1O00499 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
BIN1O00499 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BIN1O00499 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BIN1O00499 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BIN1O00499 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BIN1O00499 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
BIN1O00499 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BIN1O00499 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
BIN1O00499 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
BIN1O00499 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BIN1O00499 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BIN1O00499 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BIN1O00499 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
BIN1O00499 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BIN1O00499 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
BIN1O00499 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
BIN1O00499 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BIN1O00499 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
BIN1O00499 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
BIN1O00499 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BIN1O00499 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
BIN1O00499 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
BIN1O00499 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
BIN1O00499 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
BIN1O00499 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
BIN1O00499 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
BIN1O00499 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
BIN1O00499 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BIN1O00499 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
BIN1O00499 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BIN1O00499 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BIN1O00499 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
BIN1O00499 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
BIN1O00499 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BIN1O00499 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BIN1O00499 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BIN1O00499 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BIN1O00499 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BIN1O00499 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
BIN1O00499 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.08
BIN1O00499 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BIN1O00499 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
BIN1O00499 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
BIN1O00499 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BIN1O00499 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIN1O00499 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIN1O00499 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIN1O00499 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIN1O00499 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BIN1O00499 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIN1O00499 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIN1O00499 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIN1O00499 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIN1O00499 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIN1O00499 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BIN1O00499 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
BIN1O00499 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIN1O00499 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIN1O00499 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIN1O00499 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
BIN1O00499 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIN1O00499 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BIN1O00499 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BIN1O00499 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIN1O00499 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
BIN1O00499 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BIN1O00499 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
BIN1O00499 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BIN1O00499 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BIN1O00499 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BIN1O00499 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BIN1O00499 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BIN1O00499 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BIN1O00499 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BIN1O00499 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BIN1O00499 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BIN1O00499 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BIN1O00499 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BIN1O00499 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BIN1O00499 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
BIN1O00499 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BIN1O00499 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BIN1O00499 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BIN1O00499 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
BIN1O00499 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms