Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.38■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC45.37■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.35■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC45.35■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.34■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC45.32■■■■■ 4.85
SUPT5HO00267 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC45.31■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC45.3■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC45.29■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC45.29■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC45.28■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.27■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC45.27■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.26■■■■■ 4.84
SUPT5HO00267 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC45.25■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.22■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.22■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.22■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.21■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC45.2■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC45.2■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC45.2■■■■■ 4.83
SUPT5HO00267 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC45.19■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC45.19■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.18■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC45.16■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC45.16■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC45.15■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.15■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC45.14■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.13■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC45.13■■■■■ 4.82
SUPT5HO00267 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.12■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC45.12■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC45.11■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC45.11■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC45.1■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC45.1■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.1■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC45.09■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC45.09■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC45.08■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.08■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC45.08■■■■■ 4.81
SUPT5HO00267 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.06■■■■■ 4.8
SUPT5HO00267 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC45.05■■■■■ 4.8
SUPT5HO00267 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC45.05■■■■■ 4.8
SUPT5HO00267 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC45.04■■■■■ 4.8
SUPT5HO00267 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.03■■■■■ 4.8
SUPT5HO00267 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC45.03■■■■■ 4.8
SUPT5HO00267 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
SUPT5HO00267 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC45.02■■■■■ 4.8
SUPT5HO00267 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC45.01■■■■■ 4.8
SUPT5HO00267 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.01■■■■■ 4.8
SUPT5HO00267 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC44.99■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
SUPT5HO00267 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC44.98■■■■■ 4.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms