Protein–RNA interactions for Protein: B8ZZ34

SHISA8, Putative protein shisa-8, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHISA8B8ZZ34 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SHISA8B8ZZ34 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SHISA8B8ZZ34 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SHISA8B8ZZ34 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SHISA8B8ZZ34 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SHISA8B8ZZ34 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA8B8ZZ34 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA8B8ZZ34 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA8B8ZZ34 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SHISA8B8ZZ34 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms