Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NOTOA8MTQ0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NOTOA8MTQ0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NOTOA8MTQ0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms