RNA–Protein interactions for RNA: YBR273C

UBX7, Transcript of UBX (ubiquitin regulatory X) domain-containing protein, yeast

Gene UBX7, Length 1,311 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UBX7	YBR273C	MTC1	P47018	478 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
UBX7	YBR273C	FAP1	P53971	965 aa		9.66	□□□□□ -0.86
UBX7	YBR273C	PRY3	P47033	881 aa		9.1	□□□□□ -0.95
UBX7	YBR273C	AAD16	Q02895	342 aa		8.83	□□□□□ -1
UBX7	YBR273C	PRI1	P10363	409 aa		8.8	□□□□□ -1
UBX7	YBR273C	DRS1	P32892	752 aa	Known RBP	8.66	□□□□□ -1.02
UBX7	YBR273C	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	8.6	□□□□□ -1.03
UBX7	YBR273C	YCK3	P39962	524 aa		8.59	□□□□□ -1.03
UBX7	YBR273C	ISW2	Q08773	1120 aa		8.45	□□□□□ -1.06
UBX7	YBR273C	RPG1	P38249	964 aa	Known RBP	8.34	□□□□□ -1.07
UBX7	YBR273C	SGS1	P35187	1447 aa		8.3	□□□□□ -1.08
UBX7	YBR273C	TSR3	Q12094	313 aa	Known RBP	8.23	□□□□□ -1.09
UBX7	YBR273C	INO80	P53115	1489 aa		8.18	□□□□□ -1.1
UBX7	YBR273C	SPA2	P23201	1466 aa	Known RBP	8.18	□□□□□ -1.1
UBX7	YBR273C	SSN2	P38931	1420 aa		8.02	□□□□□ -1.12
UBX7	YBR273C	MRPL32	P25348	183 aa		7.97	□□□□□ -1.13
UBX7	YBR273C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	7.96	□□□□□ -1.14
UBX7	YBR273C	YGL015C	P33199	130 aa		7.86	□□□□□ -1.15
UBX7	YBR273C	DIP2	Q12220	943 aa	Predicted RBP	7.85	□□□□□ -1.15
UBX7	YBR273C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		7.81	□□□□□ -1.16
UBX7	YBR273C	RSE1	Q04693	1361 aa	Known RBP	7.79	□□□□□ -1.16
UBX7	YBR273C	HSL1	P34244	1518 aa		7.7	□□□□□ -1.18
UBX7	YBR273C	SPT6	P23615	1451 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
UBX7	YBR273C	MON2	P48563	1636 aa	Predicted RBP	7.6	□□□□□ -1.19
UBX7	YBR273C	REB1	P21538	810 aa		7.58	□□□□□ -1.2
UBX7	YBR273C	HIR3	P47171	1648 aa		7.57	□□□□□ -1.2
UBX7	YBR273C	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
UBX7	YBR273C	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	7.55	□□□□□ -1.2
UBX7	YBR273C	XRN1	P22147	1528 aa	Known RBP	7.53	□□□□□ -1.2
UBX7	YBR273C	SWR1	Q05471	1514 aa		7.51	□□□□□ -1.21
UBX7	YBR273C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	7.49	□□□□□ -1.21
UBX7	YBR273C	SKI3	P17883	1432 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
UBX7	YBR273C	BUD31	P25337	157 aa	Predicted RBP	7.48	□□□□□ -1.21
UBX7	YBR273C	SIN3	P22579	1536 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBX7	YBR273C	REV3	P14284	1504 aa		7.47	□□□□□ -1.21
UBX7	YBR273C	AVT3	P36062	692 aa		7.42	□□□□□ -1.22
UBX7	YBR273C	SSK2	P53599	1579 aa		7.42	□□□□□ -1.22
UBX7	YBR273C	CHD1	P32657	1468 aa		7.41	□□□□□ -1.22
UBX7	YBR273C	CDC27	P38042	758 aa		7.41	□□□□□ -1.22
UBX7	YBR273C	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	7.38	□□□□□ -1.23
UBX7	YBR273C	UBP10	P53874	792 aa	Predicted RBP	7.37	□□□□□ -1.23
UBX7	YBR273C	ESP1	Q03018	1630 aa		7.34	□□□□□ -1.23
UBX7	YBR273C	TAF2	P23255	1407 aa		7.34	□□□□□ -1.24
UBX7	YBR273C	MMS22	Q06164	1454 aa		7.32	□□□□□ -1.24
UBX7	YBR273C	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
UBX7	YBR273C	POL1	P13382	1468 aa		7.26	□□□□□ -1.25
UBX7	YBR273C	KOG1	P38873	1557 aa		7.26	□□□□□ -1.25
UBX7	YBR273C	MAP2	P38174	421 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
UBX7	YBR273C	BUD4	P47136	1447 aa		7.25	□□□□□ -1.25
UBX7	YBR273C	STU1	P38198	1513 aa		7.24	□□□□□ -1.25
UBX7	YBR273C	YTA7	P40340	1379 aa		7.24	□□□□□ -1.25
UBX7	YBR273C	YPK9	Q12697	1472 aa		7.23	□□□□□ -1.25
UBX7	YBR273C	ATG2	P53855	1592 aa		7.22	□□□□□ -1.25
UBX7	YBR273C	SPT21	P35209	758 aa		7.21	□□□□□ -1.26
UBX7	YBR273C	DNA2	P38859	1522 aa		7.18	□□□□□ -1.26
UBX7	YBR273C	ECM5	Q03214	1411 aa		7.15	□□□□□ -1.26
UBX7	YBR273C	MYO4	P32492	1471 aa		7.15	□□□□□ -1.27
UBX7	YBR273C	YOR1	P53049	1477 aa		7.14	□□□□□ -1.27
UBX7	YBR273C	RKR1	Q04781	1562 aa		7.14	□□□□□ -1.27
UBX7	YBR273C	TFC8	Q12308	588 aa		7.13	□□□□□ -1.27
UBX7	YBR273C	PEP1	P32319	1579 aa		7.11	□□□□□ -1.27
UBX7	YBR273C	SCC2	Q04002	1493 aa		7.11	□□□□□ -1.27
UBX7	YBR273C	RPO31	P04051	1460 aa		7.1	□□□□□ -1.27
UBX7	YBR273C	BPT1	P14772	1559 aa		7.1	□□□□□ -1.27
UBX7	YBR273C	UFD4	P33202	1483 aa		7.1	□□□□□ -1.27
UBX7	YBR273C	SMC4	Q12267	1418 aa		7.09	□□□□□ -1.27
UBX7	YBR273C	MDS3	P53094	1487 aa		7.09	□□□□□ -1.27
UBX7	YBR273C	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	7.08	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	TIF4632	P39936	914 aa	Known RBP	7.07	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	TGL3	P40308	642 aa		7.07	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	TAF7	Q05021	590 aa		7.07	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	HO	P09932	586 aa		7.06	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	UBP9	P39967	754 aa		7.04	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	SAS10	Q12136	610 aa	Predicted RBP	7.04	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	TRM732	Q03496	1420 aa		7.03	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	7.03	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	DCD1	P06773	312 aa		7.02	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	SIS1	P25294	352 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.28
UBX7	YBR273C	SNQ2	P32568	1501 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	SCY1	P53009	804 aa		7	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	SLX5	P32828	619 aa	Known RBP	6.99	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	NUP170	P38181	1502 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY2B-C	P25384	1770 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	6.98	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		6.98	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	STH1	P32597	1359 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	MLP2	P40457	1679 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	SPP41	P38904	1435 aa		6.97	□□□□□ -1.29
UBX7	YBR273C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		6.93	□□□□□ -1.3
UBX7	YBR273C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	6.93	□□□□□ -1.3
UBX7	YBR273C	BFR2	Q06631	534 aa	Known RBP	6.91	□□□□□ -1.3

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.7 ms