RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599699.2

SSBP4-206, Transcript of single stranded DNA binding protein 4, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SSBP4, Length 793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP4-206ENST00000599699 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.41■■■■■ 5.18
SSBP4-206ENST00000599699 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa47.4■■■■■ 5.18
SSBP4-206ENST00000599699 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.38■■■■■ 5.17
SSBP4-206ENST00000599699 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.37■■■■■ 5.17
SSBP4-206ENST00000599699 CHIC1Q5VXU3 224 aa47.31■■■■■ 5.16
SSBP4-206ENST00000599699 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.16■■■■■ 5.14
SSBP4-206ENST00000599699 PRXQ9BXM0 1461 aa47.14■■■■■ 5.14
SSBP4-206ENST00000599699 EEA1Q15075 1411 aa47.12■■■■■ 5.13
SSBP4-206ENST00000599699 IQGAP2Q13576 1575 aa47.1■■■■■ 5.13
SSBP4-206ENST00000599699 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP47.08■■■■■ 5.13
SSBP4-206ENST00000599699 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa46.96■■■■■ 5.11
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SSBP4-206ENST00000599699 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP46.85■■■■■ 5.09
SSBP4-206ENST00000599699 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa46.85■■■■■ 5.09
SSBP4-206ENST00000599699 UGGT2Q9NYU1 1516 aa46.82■■■■■ 5.09
SSBP4-206ENST00000599699 PTPRGP23470 1445 aa46.79■■■■■ 5.08
SSBP4-206ENST00000599699 TNIKQ9UKE5 1360 aa46.79■■■■■ 5.08
SSBP4-206ENST00000599699 DISP1Q96F81 1524 aa46.77■■■■■ 5.08
SSBP4-206ENST00000599699 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP46.65■■■■■ 5.06
SSBP4-206ENST00000599699 KIAA0556O60303 1618 aa46.64■■■■■ 5.06
SSBP4-206ENST00000599699 GOLGA3Q08378 1498 aa46.61■■■■■ 5.05
SSBP4-206ENST00000599699 KIF21BO75037 1637 aa46.6■■■■■ 5.05
SSBP4-206ENST00000599699 ADCY10Q96PN6 1610 aa46.59■■■■■ 5.05
SSBP4-206ENST00000599699 EHMT2Q96KQ7 1210 aa46.55■■■■■ 5.04
SSBP4-206ENST00000599699 UACAQ9BZF9 1416 aa46.45■■■■■ 5.03
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SSBP4-206ENST00000599699 P3H3Q8IVL6 736 aa46.41■■■■■ 5.02
SSBP4-206ENST00000599699 UBTFP17480 764 aaKnown RBP46.4■■■■■ 5.02
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SSBP4-206ENST00000599699 FAM69CQ0P6D2 419 aa46.17■■■■■ 4.98
SSBP4-206ENST00000599699 ABCC10Q5T3U5 1492 aa46.15■■■■■ 4.98
SSBP4-206ENST00000599699 KDM5BQ9UGL1 1544 aa46.13■■■■■ 4.98
SSBP4-206ENST00000599699 ABCA8O94911 1581 aa46.13■■■■■ 4.97
SSBP4-206ENST00000599699 ASXL2Q76L83 1435 aa46.1■■■■■ 4.97
SSBP4-206ENST00000599699 FHOD3Q2V2M9 1422 aa46.09■■■■■ 4.97
SSBP4-206ENST00000599699 KIF13AQ9H1H9 1805 aa46.08■■■■■ 4.97
SSBP4-206ENST00000599699 EFCAB5A4FU69 1503 aa46.06■■■■■ 4.96
SSBP4-206ENST00000599699 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP46.04■■■■■ 4.96
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SSBP4-206ENST00000599699 ARID3CA6NKF2 412 aa45.95■■■■■ 4.95
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SSBP4-206ENST00000599699 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa45.83■■■■■ 4.93
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SSBP4-206ENST00000599699 ATP10BO94823 1461 aa45.8■■■■■ 4.92
SSBP4-206ENST00000599699 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP45.79■■■■■ 4.92
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SSBP4-206ENST00000599699 KCNH8Q96L42 1107 aa45.73■■■■■ 4.91
SSBP4-206ENST00000599699 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP45.73■■■■■ 4.91
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SSBP4-206ENST00000599699 FMN1Q68DA7 1419 aa45.69■■■■■ 4.91
SSBP4-206ENST00000599699 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP45.63■■■■■ 4.9
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SSBP4-206ENST00000599699 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa45.53■■■■■ 4.88
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SSBP4-206ENST00000599699 HECW1Q76N89 1606 aa45.45■■■■■ 4.87
SSBP4-206ENST00000599699 CD109Q6YHK3 1445 aa45.45■■■■■ 4.87
SSBP4-206ENST00000599699 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP45.44■■■■■ 4.87
SSBP4-206ENST00000599699 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa45.43■■■■■ 4.86
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SSBP4-206ENST00000599699 TEX14Q8IWB6 1497 aa45.42■■■■■ 4.86
SSBP4-206ENST00000599699 CFAP43Q8NDM7 1665 aa45.39■■■■■ 4.86
SSBP4-206ENST00000599699 KDM6BO15054 1643 aa45.38■■■■■ 4.86
SSBP4-206ENST00000599699 CEP162Q5TB80 1403 aa45.32■■■■■ 4.85
SSBP4-206ENST00000599699 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa45.3■■■■■ 4.84
SSBP4-206ENST00000599699 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa45.3■■■■■ 4.84
SSBP4-206ENST00000599699 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP45.28■■■■■ 4.84
SSBP4-206ENST00000599699 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP45.27■■■■■ 4.84
SSBP4-206ENST00000599699 ABCA9Q8IUA7 1624 aa45.26■■■■■ 4.84
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SSBP4-206ENST00000599699 CCDC18Q5T9S5 1454 aa45.14■■■■■ 4.82
SSBP4-206ENST00000599699 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa45.12■■■■■ 4.81
SSBP4-206ENST00000599699 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP45.11■■■■■ 4.81
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SSBP4-206ENST00000599699 CFAP74Q9C0B2 1584 aa44.8■■■■■ 4.76
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SSBP4-206ENST00000599699 VPS8Q8N3P4 1428 aa44.76■■■■■ 4.76
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SSBP4-206ENST00000599699 MTUS2Q5JR59 1369 aa44.73■■■■■ 4.75
SSBP4-206ENST00000599699 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP44.68■■■■■ 4.74
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SSBP4-206ENST00000599699 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP44.61■■■■■ 4.73
SSBP4-206ENST00000599699 SCAPERQ9BY12 1400 aa44.59■■■■■ 4.73
SSBP4-206ENST00000599699 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa44.58■■■■■ 4.73
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