RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577988.2

SNORD3B-1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3B-1, humanhuman

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Gene SNORD3B-1, Length 758 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 ARAP1Q96P48 1450 aa23.03■■□□□ 1.28
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 ADCY10Q96PN6 1610 aa22.62■■□□□ 1.21
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 FMN1Q68DA7 1419 aa22.43■■□□□ 1.18
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa22.42■■□□□ 1.18
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 ASXL2Q76L83 1435 aa22.39■■□□□ 1.17
SNORD3B-1-201ENST00000577988 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.37■■□□□ 1.17
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.34■■□□□ 1.17
SNORD3B-1-201ENST00000577988 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.16
SNORD3B-1-201ENST00000577988 DIP2BQ9P265 1576 aa22.32■■□□□ 1.16
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CEP162Q5TB80 1403 aa22.31■■□□□ 1.16
SNORD3B-1-201ENST00000577988 WDR7Q9Y4E6 1490 aa22.3■■□□□ 1.16
SNORD3B-1-201ENST00000577988 GLI2P10070 1586 aa22.29■■□□□ 1.16
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.25■■□□□ 1.15
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ARID3CA6NKF2 412 aa22.25■■□□□ 1.15
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa22.24■■□□□ 1.15
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.18■■□□□ 1.14
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.15■■□□□ 1.14
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.14■■□□□ 1.14
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CFAP43Q8NDM7 1665 aa22.13■■□□□ 1.13
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TSPOAP1O95153 1857 aa22.13■■□□□ 1.13
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CD109Q6YHK3 1445 aa22.11■■□□□ 1.13
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.09■■□□□ 1.13
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ABCA9Q8IUA7 1624 aa22.09■■□□□ 1.13
SNORD3B-1-201ENST00000577988 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa22.08■■□□□ 1.13
SNORD3B-1-201ENST00000577988 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa22.07■■□□□ 1.12
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SNORD3B-1-201ENST00000577988 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.06■■□□□ 1.12
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 PHLDB1Q86UU1 1377 aa22.01■■□□□ 1.11
SNORD3B-1-201ENST00000577988 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
SNORD3B-1-201ENST00000577988 KIF14Q15058 1648 aa21.96■■□□□ 1.11
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 MTUS2Q5JR59 1369 aa21.93■■□□□ 1.1
SNORD3B-1-201ENST00000577988 NEO1Q92859 1461 aa21.93■■□□□ 1.1
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.91■■□□□ 1.1
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 ARAP3Q8WWN8 1544 aa21.9■■□□□ 1.1
SNORD3B-1-201ENST00000577988 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa21.88■■□□□ 1.09
SNORD3B-1-201ENST00000577988 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.88■■□□□ 1.09
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CFAP74Q9C0B2 1584 aa21.87■■□□□ 1.09
SNORD3B-1-201ENST00000577988 APLP2Q06481 763 aa21.87■■□□□ 1.09
SNORD3B-1-201ENST00000577988 TIAM1Q13009 1591 aa21.87■■□□□ 1.09
SNORD3B-1-201ENST00000577988 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa21.86■■□□□ 1.09
SNORD3B-1-201ENST00000577988 FANCAO15360 1455 aa21.86■■□□□ 1.09
SNORD3B-1-201ENST00000577988 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
SNORD3B-1-201ENST00000577988 AKNAQ7Z591 1439 aa21.83■■□□□ 1.09
SNORD3B-1-201ENST00000577988 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa21.79■■□□□ 1.08
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.78■■□□□ 1.08
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.78■■□□□ 1.08
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