RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577988.2

SNORD3B-1-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 3B-1, humanhuman

BASIC

Gene SNORD3B-1, Length 758 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD3B-1-201ENST00000577988 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.45■■■□□ 2.95
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.7■■□□□ 1.71
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.7■■□□□ 1.54
SNORD3B-1-201ENST00000577988 PRDM2Q13029 1718 aa24.69■■□□□ 1.54
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CUX2O14529 1486 aa24.66■■□□□ 1.54
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.66■■□□□ 1.54
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 WDR62O43379 1518 aa24.51■■□□□ 1.51
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa23.99■■□□□ 1.43
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa23.96■■□□□ 1.43
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
SNORD3B-1-201ENST00000577988 SYNJ1O43426 1573 aa23.93■■□□□ 1.42
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa23.87■■□□□ 1.41
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.71■■□□□ 1.39
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 TRIM41Q8WV44 630 aa23.61■■□□□ 1.37
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.6■■□□□ 1.37
SNORD3B-1-201ENST00000577988 KIF27Q86VH2 1401 aa23.59■■□□□ 1.37
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.51■■□□□ 1.35
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SNORD3B-1-201ENST00000577988 EEA1Q15075 1411 aa23.26■■□□□ 1.31
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CEP170Q5SW79 1584 aa23.25■■□□□ 1.31
SNORD3B-1-201ENST00000577988 ARHGEF11O15085 1522 aa23.22■■□□□ 1.31
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.21■■□□□ 1.31
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.2■■□□□ 1.3
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.2■■□□□ 1.3
SNORD3B-1-201ENST00000577988 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.2■■□□□ 1.3
SNORD3B-1-201ENST00000577988 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.2■■□□□ 1.3
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