RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215904.6

PDXP-201, Transcript of pyridoxal phosphatase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDXP, Length 2,010 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXP-201ENST00000215904 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.2■■■■■ 4.35
PDXP-201ENST00000215904 TIAM1Q13009 1591 aa42.14■■■■■ 4.34
PDXP-201ENST00000215904 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
PDXP-201ENST00000215904 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.11■■■■■ 4.33
PDXP-201ENST00000215904 WDR62O43379 1518 aa42.06■■■■■ 4.32
PDXP-201ENST00000215904 PBRM1Q86U86 1689 aa42.03■■■■■ 4.32
PDXP-201ENST00000215904 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.01■■■■■ 4.32
PDXP-201ENST00000215904 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP42■■■■■ 4.317e-7■■■■□ 22.3
PDXP-201ENST00000215904 FHOD3Q2V2M9 1422 aa42■■■■■ 4.31
PDXP-201ENST00000215904 CFAP43Q8NDM7 1665 aa41.98■■■■■ 4.31
PDXP-201ENST00000215904 FYCO1Q9BQS8 1478 aa41.95■■■■■ 4.31
PDXP-201ENST00000215904 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.95■■■■■ 4.31
PDXP-201ENST00000215904 IFT140Q96RY7 1462 aa41.95■■■■■ 4.31
PDXP-201ENST00000215904 SAMD9Q5K651 1589 aa41.94■■■■■ 4.3
PDXP-201ENST00000215904 P3H3Q8IVL6 736 aa41.93■■■■■ 4.3
PDXP-201ENST00000215904 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.92■■■■■ 4.3
PDXP-201ENST00000215904 FMN1Q68DA7 1419 aa41.87■■■■■ 4.29
PDXP-201ENST00000215904 ADAMTS12P58397 1594 aa41.87■■■■■ 4.29
PDXP-201ENST00000215904 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.87■■■■■ 4.29
PDXP-201ENST00000215904 GRIN2BQ13224 1484 aa41.86■■■■■ 4.29
PDXP-201ENST00000215904 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.76■■■■■ 4.28
PDXP-201ENST00000215904 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
PDXP-201ENST00000215904 ERCC6Q03468 1493 aa41.73■■■■■ 4.27
PDXP-201ENST00000215904 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP41.7■■■■■ 4.27
PDXP-201ENST00000215904 PHLDB1Q86UU1 1377 aa41.63■■■■■ 4.26
PDXP-201ENST00000215904 IQGAP2Q13576 1575 aa41.63■■■■■ 4.26
PDXP-201ENST00000215904 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
PDXP-201ENST00000215904 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.57■■■■■ 4.25
PDXP-201ENST00000215904 CLSPNQ9HAW4 1339 aa41.55■■■■■ 4.24
PDXP-201ENST00000215904 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP41.5■■■■■ 4.23
PDXP-201ENST00000215904 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.49■■■■■ 4.23
PDXP-201ENST00000215904 UGGT2Q9NYU1 1516 aa41.47■■■■■ 4.23
PDXP-201ENST00000215904 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.42■■■■■ 4.22
PDXP-201ENST00000215904 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa41.4■■■■■ 4.22
PDXP-201ENST00000215904 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
PDXP-201ENST00000215904 GRIN2AQ12879 1464 aa41.39■■■■■ 4.22
PDXP-201ENST00000215904 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.35■■■■■ 4.21
PDXP-201ENST00000215904 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.34■■■■■ 4.21
PDXP-201ENST00000215904 ITGAEP38570 1179 aa41.32■■■■■ 4.2
PDXP-201ENST00000215904 HECW1Q76N89 1606 aa41.31■■■■■ 4.2
PDXP-201ENST00000215904 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.3■■■■■ 4.2
PDXP-201ENST00000215904 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.25■■■■■ 4.19
PDXP-201ENST00000215904 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.25■■■■■ 4.19
PDXP-201ENST00000215904 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa41.24■■■■■ 4.19
PDXP-201ENST00000215904 SYNJ2O15056 1496 aa41.24■■■■■ 4.19
PDXP-201ENST00000215904 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.23■■■■■ 4.19
PDXP-201ENST00000215904 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
PDXP-201ENST00000215904 KIAA0556O60303 1618 aa41.21■■■■■ 4.19
PDXP-201ENST00000215904 NCOA2Q15596 1464 aa41.21■■■■■ 4.19
PDXP-201ENST00000215904 DISP1Q96F81 1524 aa41.2■■■■■ 4.19
PDXP-201ENST00000215904 ARHGEF11O15085 1522 aa41.17■■■■■ 4.18
PDXP-201ENST00000215904 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
PDXP-201ENST00000215904 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP41.15■■■■■ 4.18
PDXP-201ENST00000215904 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa41.14■■■■■ 4.18
PDXP-201ENST00000215904 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.12■■■■■ 4.17
PDXP-201ENST00000215904 CEP170Q5SW79 1584 aa41.1■■■■■ 4.17
PDXP-201ENST00000215904 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP41.08■■■■■ 4.17
PDXP-201ENST00000215904 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP41.06■■■■■ 4.16
PDXP-201ENST00000215904 NUP160Q12769 1436 aa41.03■■■■■ 4.16
PDXP-201ENST00000215904 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
PDXP-201ENST00000215904 MAPKBP1O60336 1514 aa40.98■■■■■ 4.15
PDXP-201ENST00000215904 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa40.93■■■■■ 4.14
PDXP-201ENST00000215904 PTPN23Q9H3S7 1636 aa40.93■■■■■ 4.14
PDXP-201ENST00000215904 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
PDXP-201ENST00000215904 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.14
PDXP-201ENST00000215904 PTPRKQ15262 1439 aa40.87■■■■■ 4.13
PDXP-201ENST00000215904 FBLN2P98095 1184 aa40.84■■■■■ 4.13
PDXP-201ENST00000215904 HFM1A2PYH4 1435 aa40.84■■■■■ 4.13
PDXP-201ENST00000215904 MIA2Q96PC5 1412 aa40.81■■■■■ 4.12
PDXP-201ENST00000215904 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa40.8■■■■■ 4.12
PDXP-201ENST00000215904 JPH4Q96JJ6 628 aa40.77■■■■■ 4.12
PDXP-201ENST00000215904 NAIPQ13075 1403 aa40.7■■■■■ 4.11
PDXP-201ENST00000215904 ARID3CA6NKF2 412 aa40.67■■■■■ 4.1
PDXP-201ENST00000215904 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP40.67■■■■■ 4.1
PDXP-201ENST00000215904 PLB1Q6P1J6 1458 aa40.65■■■■■ 4.1
PDXP-201ENST00000215904 AKNAQ7Z591 1439 aa40.62■■■■■ 4.09
PDXP-201ENST00000215904 UACAQ9BZF9 1416 aa40.61■■■■■ 4.09
PDXP-201ENST00000215904 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP40.58■■■■■ 4.09
PDXP-201ENST00000215904 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.55■■■■■ 4.08
PDXP-201ENST00000215904 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.55■■■■■ 4.08
PDXP-201ENST00000215904 ABCA8O94911 1581 aa40.55■■■■■ 4.08
PDXP-201ENST00000215904 ADCY10Q96PN6 1610 aa40.51■■■■■ 4.08
PDXP-201ENST00000215904 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP40.48■■■■■ 4.07
PDXP-201ENST00000215904 CHD1O14646 1710 aa40.47■■■■■ 4.07
PDXP-201ENST00000215904 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.46■■■■■ 4.07
PDXP-201ENST00000215904 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
PDXP-201ENST00000215904 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.4■■■■■ 4.06
PDXP-201ENST00000215904 DAPK1P53355 1430 aa40.39■■■■■ 4.06
PDXP-201ENST00000215904 ROCK1Q13464 1354 aa40.37■■■■■ 4.05
PDXP-201ENST00000215904 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.36■■■■■ 4.05
PDXP-201ENST00000215904 NEUROD1Q13562 356 aa40.35■■■■■ 4.05
PDXP-201ENST00000215904 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.35■■■■■ 4.05
PDXP-201ENST00000215904 KIF14Q15058 1648 aa40.34■■■■■ 4.05
PDXP-201ENST00000215904 SHROOM2Q13796 1616 aa40.34■■■■■ 4.05
PDXP-201ENST00000215904 ABCC5O15440 1437 aa40.34■■■■■ 4.05
PDXP-201ENST00000215904 ATP10BO94823 1461 aa40.33■■■■■ 4.05
PDXP-201ENST00000215904 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.32■■■■■ 4.05
PDXP-201ENST00000215904 PTPRGP23470 1445 aa40.28■■■■■ 4.04
PDXP-201ENST00000215904 KDM6BO15054 1643 aa40.27■■■■■ 4.04
PDXP-201ENST00000215904 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.26■■■■■ 4.04
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