RNA–Protein interactions for RNA: YMR118C

SHH3, Transcript of Putative mitochondrial inner membrane protein of unknown function, yeast

Gene SHH3, Length 591 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SHH3	YMR118C	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	TRK2	P28584	889 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	DMA1	P38823	416 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	RTF1	P53064	558 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	TEA1	P47988	759 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	TSC11	P40061	1430 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	IES2	P40154	320 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	ACO2	P39533	789 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	RTT106	P40161	455 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	YJR115W	P47152	169 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	KXD1	P53158	218 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	CAF120	P53836	1060 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	SPT7	P35177	1332 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	PEP1	P32319	1579 aa		4.65	□□□□□ -1.66
SHH3	YMR118C	SIT4	P20604	311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	DSF2	P38213	736 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	MDS3	P53094	1487 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	NIS1	P53939	407 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	KOG1	P38873	1557 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	HXT10	P43581	546 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	NUP42	P49686	430 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	SLY41	P22215	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	SPB4	P25808	606 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	TPD3	P31383	635 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	YGR035C	P53222	116 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	DIT2	P21595	489 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	YMR196W	Q04336	1088 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	VPS15	P22219	1454 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	UGA3	P26370	528 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	MSB3	P48566	633 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	FPK1	P53739	893 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	ULS1	Q08562	1619 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SHH3	YMR118C	PDR10	P51533	1564 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	TY3B-G	Q99315	1547 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	KIP2	P28743	706 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	TBF1	Q02457	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	YLR346C	Q06139	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	RQC2	Q12532	1038 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	MLP2	P40457	1679 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	OPT2	Q06593	877 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	ALR1	Q08269	859 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	SRF1	Q12516	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	ICP55	P40051	511 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	PUS6	P53294	404 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	HPF1	Q05164	967 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	YDL206W	Q12424	762 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	NUP159	P40477	1460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	SNT2	P53127	1403 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	IXR1	P33417	597 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	RPA14	P50106	137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	VTH1	P40438	1549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	VTH2	P40890	1549 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	LEU3	P08638	886 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	SCJ1	P25303	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	SRB8	P25648	1427 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	CAT8	P39113	1433 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	MHP1	P43638	1398 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	DNF1	P32660	1571 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	NOP7	P53261	605 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SHH3	YMR118C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	YIR007W	P40566	764 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	LSB3	P43603	459 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.51	□□□□□ -1.69	not detected
SHH3	YMR118C	HST2	P53686	357 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	PUS1	Q12211	544 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	MMP1	Q12372	583 aa		4.51	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	NUP85	P46673	744 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	YPR204W	Q08995	1032 aa		4.5	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.49	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	CAB3	P36076	571 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	SCW11	P53189	542 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	ATF2	P53296	535 aa		4.49	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	IRC20	Q06554	1556 aa		4.48	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	4.47	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	MIP1	P15801	1254 aa		4.47	□□□□□ -1.69
SHH3	YMR118C	ESS1	P22696	170 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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