Protein–RNA interactions for Protein: P35177

SPT7, Transcriptional activator SPT7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT7P35177 NSR1YGR159C 1245 nt26.78■■□□□ 1.88
SPT7P35177 YML009W-BYML009W-B 477 nt26.7■■□□□ 1.87
SPT7P35177 NOP1YDL014W 984 nt25.63■■□□□ 1.69
SPT7P35177 MDJ1YFL016C 1536 nt24.34■■□□□ 1.49
SPT7P35177 YKL036CYKL036C 393 nt24.26■■□□□ 1.47
SPT7P35177 YJL027CYJL027C 417 nt22.82■■□□□ 1.24
SPT7P35177 Q0297Q0297 156 nt22.55■■□□□ 1.2
SPT7P35177 SRX1YKL086W 384 nt22.51■■□□□ 1.19
SPT7P35177 SCS3YGL126W 1143 nt22.39■■□□□ 1.18
SPT7P35177 DBP2YNL112W 1641 nt21.42■■□□□ 1.02
SPT7P35177 YCR051WYCR051W 669 nt21.33■■□□□ 1.01
SPT7P35177 YOL085CYOL085C 342 nt20.93■□□□□ 0.94
SPT7P35177 SCJ1YMR214W 1134 nt20.77■□□□□ 0.91
SPT7P35177 YBR190WYBR190W 312 nt20.7■□□□□ 0.9
SPT7P35177 TRN1tP(UGG)A 72 nt20.64■□□□□ 0.89
SPT7P35177 SUF9tP(UGG)F 72 nt20.64■□□□□ 0.89
SPT7P35177 SUF8tP(UGG)H 72 nt20.64■□□□□ 0.89
SPT7P35177 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt20.64■□□□□ 0.89
SPT7P35177 SUF7tP(UGG)M 72 nt20.64■□□□□ 0.89
SPT7P35177 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt20.64■□□□□ 0.89
SPT7P35177 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt20.64■□□□□ 0.89
SPT7P35177 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt20.64■□□□□ 0.89
SPT7P35177 SUF11tP(UGG)O2 72 nt20.64■□□□□ 0.89
SPT7P35177 PKP1YIL042C 1185 nt20.56■□□□□ 0.88
SPT7P35177 CCC1YLR220W 969 nt20.42■□□□□ 0.86
SPT7P35177 RPP1BYDL130W 321 nt20.27■□□□□ 0.83
SPT7P35177 ATS1YAL020C 1002 nt20.23■□□□□ 0.83
SPT7P35177 RTC3YHR087W 336 nt20.22■□□□□ 0.83
SPT7P35177 RVS167YDR388W 1449 nt19.77■□□□□ 0.76
SPT7P35177 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt19.39■□□□□ 0.69
SPT7P35177 PET122YER153C 765 nt19.37■□□□□ 0.69
SPT7P35177 SCR1SCR1 522 nt19.37■□□□□ 0.69
SPT7P35177 PUT4YOR348C 1884 nt19.22■□□□□ 0.67
SPT7P35177 SHR5YOL110W 714 nt19.09■□□□□ 0.65
SPT7P35177 SSA3YBL075C 1950 nt18.87■□□□□ 0.61
SPT7P35177 URN1YPR152C 1398 nt18.85■□□□□ 0.61
SPT7P35177 DEP1YAL013W 1218 nt18.79■□□□□ 0.6
SPT7P35177 RRN5YLR141W 1092 nt18.77■□□□□ 0.6
SPT7P35177 ARE1YCR048W 1833 nt18.77■□□□□ 0.6
SPT7P35177 RSB1YOR049C 1065 nt18.7■□□□□ 0.58
SPT7P35177 YDJ1YNL064C 1230 nt18.69■□□□□ 0.58
SPT7P35177 SAH1YER043C 1350 nt18.68■□□□□ 0.58
SPT7P35177 OPI9YLR338W 858 nt18.62■□□□□ 0.57
SPT7P35177 PST2YDR032C 597 nt18.56■□□□□ 0.56
SPT7P35177 POA1YBR022W 534 nt18.56■□□□□ 0.56
SPT7P35177 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt18.49■□□□□ 0.55
SPT7P35177 GAR1YHR089C 618 nt18.41■□□□□ 0.54
SPT7P35177 YER088W-BYER088W-B 147 nt18.4■□□□□ 0.54
SPT7P35177 YKL097CYKL097C 411 nt18.33■□□□□ 0.53
SPT7P35177 YNL208WYNL208W 600 nt18.31■□□□□ 0.52
SPT7P35177 RPN10YHR200W 807 nt18.3■□□□□ 0.52
SPT7P35177 BSC6YOL137W 1494 nt18.24■□□□□ 0.51
SPT7P35177 PUN1YLR414C 792 nt18■□□□□ 0.47
SPT7P35177 BUD23YCR047C 828 nt17.98■□□□□ 0.47
SPT7P35177 PTC2YER089C 1395 nt17.94■□□□□ 0.46
SPT7P35177 YJR018WYJR018W 363 nt17.92■□□□□ 0.46
SPT7P35177 TIR1YER011W 765 nt17.79■□□□□ 0.44
SPT7P35177 SPT5YML010W 3192 nt17.78■□□□□ 0.44
SPT7P35177 YJR120WYJR120W 351 nt17.77■□□□□ 0.44
SPT7P35177 SSA1YAL005C 1929 nt17.75■□□□□ 0.43
SPT7P35177 NAB2YGL122C 1578 nt17.7■□□□□ 0.42
SPT7P35177 SHU1YHL006C 453 nt17.66■□□□□ 0.42
SPT7P35177 FIS1YIL065C 468 nt17.57■□□□□ 0.4
SPT7P35177 SRB2YHR041C 633 nt17.56■□□□□ 0.4
SPT7P35177 DAL1YIR027C 1383 nt17.42■□□□□ 0.38
SPT7P35177 FPR4YLR449W 1179 nt17.39■□□□□ 0.37
SPT7P35177 RPP2BYDR382W 333 nt17.34■□□□□ 0.37
SPT7P35177 YOR139CYOR139C 393 nt17.33■□□□□ 0.36
SPT7P35177 PHO4YFR034C 939 nt17.31■□□□□ 0.36
SPT7P35177 INM2YDR287W 879 nt17.23■□□□□ 0.35
SPT7P35177 SSA4YER103W 1929 nt17.23■□□□□ 0.35
SPT7P35177 NPL3YDR432W 1245 nt17.2■□□□□ 0.34
SPT7P35177 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt17.19■□□□□ 0.34
SPT7P35177 MEP2YNL142W 1500 nt17.14■□□□□ 0.33
SPT7P35177 YBL100CYBL100C 315 nt17.11■□□□□ 0.33
SPT7P35177 YPS1YLR120C 1710 nt17.11■□□□□ 0.33
SPT7P35177 BDH2YAL061W 1254 nt17.03■□□□□ 0.32
SPT7P35177 WWM1YFL010C 636 nt17.01■□□□□ 0.31
SPT7P35177 DCW1YKL046C 1350 nt16.97■□□□□ 0.31
SPT7P35177 YDR095CYDR095C 411 nt16.94■□□□□ 0.3
SPT7P35177 FUN26YAL022C 1554 nt16.9■□□□□ 0.3
SPT7P35177 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt16.89■□□□□ 0.29
SPT7P35177 YGR021WYGR021W 873 nt16.7■□□□□ 0.26
SPT7P35177 TRM9YML014W 840 nt16.7■□□□□ 0.26
SPT7P35177 YOL037CYOL037C 354 nt16.7■□□□□ 0.26
SPT7P35177 PTP1YDL230W 1008 nt16.7■□□□□ 0.26
SPT7P35177 HOM6YJR139C 1080 nt16.69■□□□□ 0.26
SPT7P35177 LSM3YLR438C-A 270 nt16.67■□□□□ 0.26
SPT7P35177 CAC2YML102W 1407 nt16.65■□□□□ 0.26
SPT7P35177 EMI2YDR516C 1503 nt16.65■□□□□ 0.26
SPT7P35177 BDF1YLR399C 2061 nt16.64■□□□□ 0.26
SPT7P35177 MNP1YGL068W 585 nt16.64■□□□□ 0.25
SPT7P35177 ALF1YNL148C 765 nt16.64■□□□□ 0.25
SPT7P35177 CCT6YDR188W 1641 nt16.63■□□□□ 0.25
SPT7P35177 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt16.63■□□□□ 0.25
SPT7P35177 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt16.61■□□□□ 0.25
SPT7P35177 IMT4tM(CAU)E 72 nt16.61■□□□□ 0.25
SPT7P35177 IMT3tM(CAU)J3 72 nt16.61■□□□□ 0.25
SPT7P35177 IMT1tM(CAU)O1 72 nt16.61■□□□□ 0.25
SPT7P35177 IMT2tM(CAU)P 72 nt16.61■□□□□ 0.25
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