RNA–Protein interactions for RNA: YPR179C

HDA3, Transcript of Subunit of the HDA1 histone deacetylase complex, yeastyeast

Gene HDA3, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA3YPR179C TY1A-ORP0CX59 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-PR2P0CX60 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-DR5P0CX65 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-ER2P0CX66 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-GR3P0CX67 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-LR1P0CX68 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-MR2P0CX69 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-JR2P47099 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-DR1Q03856 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-BRQ12217 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-NL2Q12470 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C TY1A-GR2Q12485 440 aa4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C GCD11P32481 527 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C SPT16P32558 1035 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C DSF2P38213 736 aa4.4□□□□□ -1.7
HDA3YPR179C MTC5Q03897 1148 aa4.4□□□□□ -1.71
HDA3YPR179C CLB5P30283 435 aa4.39□□□□□ -1.71
HDA3YPR179C BRE2P43132 505 aa4.39□□□□□ -1.71
HDA3YPR179C GCR2Q01722 534 aa4.39□□□□□ -1.71
HDA3YPR179C PAT1P25644 796 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
HDA3YPR179C CST6P40535 587 aa4.38□□□□□ -1.71
HDA3YPR179C LAM6Q08001 693 aa4.38□□□□□ -1.71
HDA3YPR179C MAM3Q12296 706 aa4.38□□□□□ -1.71
HDA3YPR179C RRN7P40992 514 aa4.36□□□□□ -1.71
HDA3YPR179C RTF1P53064 558 aa4.35□□□□□ -1.71
HDA3YPR179C NUP42P49686 430 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
HDA3YPR179C KEX2P13134 814 aa4.33□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C BDP1P46678 594 aa4.33□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C HED1Q03937 162 aa4.33□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C CDC4P07834 779 aa4.33□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C SIT4P20604 311 aa4.33□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C AIR1P40507 360 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C ERF2Q06551 359 aa4.33□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C MOD5P07884 428 aa4.32□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C IES2P40154 320 aa4.32□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C AGE1Q04412 482 aa4.32□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C CLA4P48562 842 aa4.31□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C YNL115CP53925 644 aa4.31□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C TEA1P47988 759 aa4.31□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C TUB4P53378 473 aa4.3□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C PAC1P39946 494 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C DIT2P21595 489 aa4.28□□□□□ -1.72
HDA3YPR179C TPD3P31383 635 aa4.27□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C NIS1P53939 407 aa4.27□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C AFT1P22149 690 aa4.24□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C KXD1P53158 218 aa4.24□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C HXT10P43581 546 aa4.23□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C FPK1P53739 893 aa4.23□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C MET32Q12041 191 aa4.23□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C ASH1P34233 588 aa4.22□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C ENV9Q08651 330 aa4.22□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C MET22P32179 357 aa4.22□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C RRD1P40454 393 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
HDA3YPR179C SLY41P22215 453 aa4.21□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data4.21□□□□□ -1.74not detected
HDA3YPR179C HST2P53686 357 aa4.21□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C YMR196WQ04336 1088 aa4.21□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C RPA14P50106 137 aa4.2□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C PUS6P53294 404 aa4.2□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C HST3P53687 447 aa4.2□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C PUS5Q06244 254 aa4.2□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C YPR097WQ06839 1073 aa4.2□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C PDC1P06169 563 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C SYH1Q02875 849 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C YDR444WQ04093 687 aa4.18□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C ALR1Q08269 859 aa4.18□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C LCB5Q06147 687 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C AIM7Q12156 149 aa4.18□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C LEU3P08638 886 aa4.17□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C RTT106P40161 455 aa4.17□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C ATF2P53296 535 aa4.17□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C TBF1Q02457 562 aa4.16□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C GLN1P32288 370 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C GLC3P32775 704 aa4.16□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C YJR115WP47152 169 aa4.16□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C MMP1Q12372 583 aa4.16□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C YDL206WQ12424 762 aa4.16□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C TRM1P15565 570 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C MRT4P33201 236 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
HDA3YPR179C SCJ1P25303 377 aa4.14□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C YDL176WQ12027 708 aa4.13□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C KIP2P28743 706 aa4.13□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C RSC30P38781 883 aa4.13□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C UGA3P26370 528 aa4.12□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C IXR1P33417 597 aa4.12□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C ESS1P22696 170 aa4.11□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C VAC17P25591 423 aa4.11□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C KTR1P27810 393 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C PTK2P47116 818 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C YLR346CQ06139 101 aa4.1□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C ACO2P39533 789 aa4.09□□□□□ -1.75
HDA3YPR179C NUP85P46673 744 aa4.09□□□□□ -1.76
HDA3YPR179C YJU3P28321 313 aa4.08□□□□□ -1.76
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