RNA–Protein interactions for RNA: YKL163W

PIR3, Transcript of O-glycosylated covalently-bound cell wall protein, yeastyeast

Gene PIR3, Length 978 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PIR3YKL163W TY1A-GR3P0CX67 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-LR1P0CX68 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-MR2P0CX69 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W GCD11P32481 527 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W NPL4P33755 580 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W CKB1P43639 278 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-JR2P47099 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-DR1Q03856 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-BRQ12217 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-NL2Q12470 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W TY1A-GR2Q12485 440 aa7.02□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W SEC2P17065 759 aa7.01□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W YEL077CQ3E7X8 1277 aa7□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PIR3YKL163W ERF2Q06551 359 aa6.96□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W TRK1P12685 1235 aa6.95□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W CST6P40535 587 aa6.95□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W MAM3Q12296 706 aa6.95□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W ERG12P07277 443 aa6.94□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W KEX2P13134 814 aa6.94□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W LEO1P38439 464 aa6.94□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W IES2P40154 320 aa6.93□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W RRN7P40992 514 aa6.93□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W SGS1P35187 1447 aa6.93□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W CLA4P48562 842 aa6.92□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W DSF2P38213 736 aa6.91□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
PIR3YKL163W SPA2P23201 1466 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.31
PIR3YKL163W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
PIR3YKL163W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
PIR3YKL163W LAM6Q08001 693 aa6.88□□□□□ -1.31
PIR3YKL163W NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
PIR3YKL163W SPT6P23615 1451 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
PIR3YKL163W DIT2P21595 489 aa6.85□□□□□ -1.31
PIR3YKL163W BDP1P46678 594 aa6.85□□□□□ -1.31
PIR3YKL163W HSL1P34244 1518 aa6.85□□□□□ -1.31
PIR3YKL163W ECM5Q03214 1411 aa6.84□□□□□ -1.31
PIR3YKL163W PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PIR3YKL163W PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PIR3YKL163W CLB5P30283 435 aa6.82□□□□□ -1.32
PIR3YKL163W TEA1P47988 759 aa6.81□□□□□ -1.32
PIR3YKL163W TUB4P53378 473 aa6.81□□□□□ -1.32
PIR3YKL163W AGE1Q04412 482 aa6.81□□□□□ -1.32
PIR3YKL163W NIS1P53939 407 aa6.79□□□□□ -1.32
PIR3YKL163W YNL115CP53925 644 aa6.78□□□□□ -1.32
PIR3YKL163W SIT4P20604 311 aa6.77□□□□□ -1.33
PIR3YKL163W MOD5P07884 428 aa6.76□□□□□ -1.33
PIR3YKL163W BRE2P43132 505 aa6.75□□□□□ -1.33
PIR3YKL163W RTF1P53064 558 aa6.75□□□□□ -1.33
PIR3YKL163W PUS5Q06244 254 aa6.75□□□□□ -1.33
PIR3YKL163W BUD4P47136 1447 aa6.74□□□□□ -1.33
PIR3YKL163W CDC4P07834 779 aa6.73□□□□□ -1.33
PIR3YKL163W HED1Q03937 162 aa6.73□□□□□ -1.33
PIR3YKL163W RGA1P39083 1007 aa6.72□□□□□ -1.33
PIR3YKL163W FPK1P53739 893 aa6.72□□□□□ -1.33
PIR3YKL163W SLY41P22215 453 aa6.7□□□□□ -1.34
PIR3YKL163W THO2P53552 1597 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
PIR3YKL163W SCJ1P25303 377 aa6.69□□□□□ -1.34
PIR3YKL163W YMR196WQ04336 1088 aa6.69□□□□□ -1.34
PIR3YKL163W MET32Q12041 191 aa6.69□□□□□ -1.34
PIR3YKL163W HIR3P47171 1648 aa6.68□□□□□ -1.34
PIR3YKL163W MDS3P53094 1487 aa6.68□□□□□ -1.34
PIR3YKL163W GCR2Q01722 534 aa6.68□□□□□ -1.34
PIR3YKL163W GAR1P28007 205 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
PIR3YKL163W ASH1P34233 588 aa6.65□□□□□ -1.34
PIR3YKL163W KXD1P53158 218 aa6.65□□□□□ -1.34
PIR3YKL163W PDC1P06169 563 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W GLC3P32775 704 aa6.63□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W HXT10P43581 546 aa6.63□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W ATF2P53296 535 aa6.63□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W RGA2Q06407 1009 aa6.62□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W REV3P14284 1504 aa6.61□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W MET22P32179 357 aa6.61□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W HST2P53686 357 aa6.61□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W YDL206WQ12424 762 aa6.61□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W TRM1P15565 570 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W AFT1P22149 690 aa6.6□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W TPD3P31383 635 aa6.6□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W PUS6P53294 404 aa6.6□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W MMP1Q12372 583 aa6.6□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W ESS1P22696 170 aa6.59□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W HST3P53687 447 aa6.59□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W TBF1Q02457 562 aa6.59□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W YPL062WQ02781 134 aa6.59□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PIR3YKL163W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data6.57□□□□□ -1.36not detected
PIR3YKL163W YJU3P28321 313 aa6.57□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W RPA14P50106 137 aa6.57□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W XRN1P22147 1528 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W GLN1P32288 370 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W YPR097WQ06839 1073 aa6.56□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W ALR1Q08269 859 aa6.56□□□□□ -1.36
PIR3YKL163W PEP1P32319 1579 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 11.9 ms