RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL063CYKL063C TY1A-NL2Q12470 440 aa7.11□□□□□ -1.27
YKL063CYKL063C TY1A-GR2Q12485 440 aa7.11□□□□□ -1.27
YKL063CYKL063C ERF2Q06551 359 aa7.1□□□□□ -1.27
YKL063CYKL063C PRT1P06103 763 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
YKL063CYKL063C SEC2P17065 759 aa7.09□□□□□ -1.27
YKL063CYKL063C DIT2P21595 489 aa7.09□□□□□ -1.27
YKL063CYKL063C GCD11P32481 527 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
YKL063CYKL063C NUP42P49686 430 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
YKL063CYKL063C SRC1Q03707 834 aa7.08□□□□□ -1.28
YKL063CYKL063C NPL4P33755 580 aa7.07□□□□□ -1.28
YKL063CYKL063C KEX2P13134 814 aa7.06□□□□□ -1.28
YKL063CYKL063C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
YKL063CYKL063C SAS4Q04003 481 aa7.04□□□□□ -1.28
YKL063CYKL063C AMS1P22855 1083 aa7.03□□□□□ -1.28
YKL063CYKL063C RRN7P40992 514 aa7.01□□□□□ -1.29
YKL063CYKL063C CST6P40535 587 aa6.99□□□□□ -1.29
YKL063CYKL063C SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C CLA4P48562 842 aa6.96□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C NIS1P53939 407 aa6.96□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C TEA1P47988 759 aa6.95□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C ERG12P07277 443 aa6.94□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C YEL077CQ3E7X8 1277 aa6.94□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C GLC3P32775 704 aa6.92□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C CLB5P30283 435 aa6.91□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C TUB4P53378 473 aa6.91□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C AGE1Q04412 482 aa6.91□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C SCJ1P25303 377 aa6.9□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C BDP1P46678 594 aa6.9□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C LAM6Q08001 693 aa6.9□□□□□ -1.3
YKL063CYKL063C FPK1P53739 893 aa6.89□□□□□ -1.31
YKL063CYKL063C SIT4P20604 311 aa6.88□□□□□ -1.31
YKL063CYKL063C YNL115CP53925 644 aa6.88□□□□□ -1.31
YKL063CYKL063C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
YKL063CYKL063C TRK1P12685 1235 aa6.86□□□□□ -1.31
YKL063CYKL063C PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
YKL063CYKL063C ATF2P53296 535 aa6.85□□□□□ -1.31
YKL063CYKL063C YMR196WQ04336 1088 aa6.85□□□□□ -1.31
YKL063CYKL063C SLY41P22215 453 aa6.84□□□□□ -1.31
YKL063CYKL063C PUS5Q06244 254 aa6.84□□□□□ -1.31
YKL063CYKL063C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
YKL063CYKL063C RTF1P53064 558 aa6.82□□□□□ -1.32
YKL063CYKL063C MOD5P07884 428 aa6.81□□□□□ -1.32
YKL063CYKL063C YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
YKL063CYKL063C ESS1P22696 170 aa6.79□□□□□ -1.32
YKL063CYKL063C KTR1P27810 393 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
YKL063CYKL063C YJU3P28321 313 aa6.76□□□□□ -1.33
YKL063CYKL063C HST2P53686 357 aa6.76□□□□□ -1.33
YKL063CYKL063C MMP1Q12372 583 aa6.76□□□□□ -1.33
YKL063CYKL063C TRM1P15565 570 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
YKL063CYKL063C YDL206WQ12424 762 aa6.75□□□□□ -1.33
YKL063CYKL063C PDC1P06169 563 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
YKL063CYKL063C GLN1P32288 370 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
YKL063CYKL063C MET32Q12041 191 aa6.72□□□□□ -1.33
YKL063CYKL063C CDC4P07834 779 aa6.71□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C HXT10P43581 546 aa6.71□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C KXD1P53158 218 aa6.71□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C PUS6P53294 404 aa6.71□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C TBF1Q02457 562 aa6.71□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C HED1Q03937 162 aa6.71□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C BRE2P43132 505 aa6.69□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C AIM7Q12156 149 aa6.68□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C ITT1Q04638 464 aa6.67□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C ASH1P34233 588 aa6.66□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C CSN12P47130 423 aa6.66□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C RPA14P50106 137 aa6.66□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C YPR097WQ06839 1073 aa6.65□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C ALR1Q08269 859 aa6.65□□□□□ -1.34
YKL063CYKL063C KIN1P13185 1064 aa6.64□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C RSC30P38781 883 aa6.64□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C ARG8P18544 423 aa6.63□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C TPD3P31383 635 aa6.63□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data6.62□□□□□ -1.35not detected
YKL063CYKL063C LEU3P08638 886 aa6.61□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C KIP2P28743 706 aa6.61□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C GAR1P28007 205 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C IXR1P33417 597 aa6.59□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C HST3P53687 447 aa6.59□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C GCR2Q01722 534 aa6.59□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C RAD59Q12223 238 aa6.59□□□□□ -1.35
YKL063CYKL063C AFT1P22149 690 aa6.58□□□□□ -1.36
YKL063CYKL063C GUA1P38625 525 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
YKL063CYKL063C YJR115WP47152 169 aa6.57□□□□□ -1.36
YKL063CYKL063C MET22P32179 357 aa6.55□□□□□ -1.36
YKL063CYKL063C APP1P53933 587 aa6.54□□□□□ -1.36
YKL063CYKL063C VAC17P25591 423 aa6.53□□□□□ -1.36
YKL063CYKL063C RPN1P38764 993 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
YKL063CYKL063C UGA3P26370 528 aa6.5□□□□□ -1.37
YKL063CYKL063C FIG4P42837 879 aa6.5□□□□□ -1.37
YKL063CYKL063C RGA1P39083 1007 aa6.49□□□□□ -1.37
YKL063CYKL063C GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data6.48□□□□□ -1.37not detected
YKL063CYKL063C MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
YKL063CYKL063C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
YKL063CYKL063C YDR444WQ04093 687 aa6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 68.5 ms