RNA–Protein interactions for RNA: YKL063C

YKL063C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKL063C, Length 504 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL063CYKL063C MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
YKL063CYKL063C DRS1P32892 752 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
YKL063CYKL063C FAP1P53971 965 aa12.05□□□□□ -0.48
YKL063CYKL063C PRY3P47033 881 aa11.34□□□□□ -0.59
YKL063CYKL063C PRI1P10363 409 aa11.28□□□□□ -0.6
YKL063CYKL063C AAD16Q02895 342 aa11.18□□□□□ -0.62
YKL063CYKL063C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
YKL063CYKL063C ISW2Q08773 1120 aa11.08□□□□□ -0.64
YKL063CYKL063C RPG1P38249 964 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
YKL063CYKL063C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
YKL063CYKL063C YCK3P39962 524 aa10.75□□□□□ -0.69
YKL063CYKL063C AVT3P36062 692 aa10.74□□□□□ -0.69
YKL063CYKL063C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.67□□□□□ -0.7
YKL063CYKL063C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.7
YKL063CYKL063C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
YKL063CYKL063C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
YKL063CYKL063C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.4□□□□□ -0.74
YKL063CYKL063C REB1P21538 810 aa10.3□□□□□ -0.76
YKL063CYKL063C MRPL32P25348 183 aa10.23□□□□□ -0.77
YKL063CYKL063C SPT21P35209 758 aa9.92□□□□□ -0.82
YKL063CYKL063C CDC27P38042 758 aa9.85□□□□□ -0.83
YKL063CYKL063C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
YKL063CYKL063C YGL015CP33199 130 aa9.72□□□□□ -0.85
YKL063CYKL063C DCD1P06773 312 aa9.69□□□□□ -0.86
YKL063CYKL063C HOP09932 586 aa9.68□□□□□ -0.86
YKL063CYKL063C TFC8Q12308 588 aa9.59□□□□□ -0.87
YKL063CYKL063C RIM101P33400 625 aa9.57□□□□□ -0.88
YKL063CYKL063C MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
YKL063CYKL063C TFA1P36100 482 aa9.39□□□□□ -0.91
YKL063CYKL063C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
YKL063CYKL063C OXP1P28273 1286 aa9.34□□□□□ -0.91
YKL063CYKL063C SCY1P53009 804 aa9.34□□□□□ -0.91
YKL063CYKL063C BCH2P36122 765 aa9.31□□□□□ -0.92
YKL063CYKL063C PTP3P40048 928 aa9.17□□□□□ -0.94
YKL063CYKL063C SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
YKL063CYKL063C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
YKL063CYKL063C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
YKL063CYKL063C EPS1P40557 701 aa9.07□□□□□ -0.96
YKL063CYKL063C BDF1P35817 686 aa9.03□□□□□ -0.96
YKL063CYKL063C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
YKL063CYKL063C RSM7P47150 247 aa8.99□□□□□ -0.97
YKL063CYKL063C TGL3P40308 642 aa8.94□□□□□ -0.98
YKL063CYKL063C AI2P03876 854 aa8.93□□□□□ -0.98
YKL063CYKL063C YLR271WQ06152 274 aa8.92□□□□□ -0.98
YKL063CYKL063C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
YKL063CYKL063C BBC1P47068 1157 aa8.85□□□□□ -0.99
YKL063CYKL063C SSP1P38871 571 aa8.78□□□□□ -1
YKL063CYKL063C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
YKL063CYKL063C CST9Q06032 482 aa8.66□□□□□ -1.02
YKL063CYKL063C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.66□□□□□ -1.02not detected
YKL063CYKL063C MRM1P25270 412 aa8.65□□□□□ -1.02
YKL063CYKL063C UBP9P39967 754 aa8.61□□□□□ -1.03
YKL063CYKL063C YOR238WQ08634 303 aa8.6□□□□□ -1.03
YKL063CYKL063C MST1P07236 462 aa8.58□□□□□ -1.04
YKL063CYKL063C PIB1Q06651 286 aa8.57□□□□□ -1.04
YKL063CYKL063C YAP5P40574 245 aa8.56□□□□□ -1.04
YKL063CYKL063C YBL029C-AQ3E756 94 aa8.56□□□□□ -1.04
YKL063CYKL063C MGA2P40578 1113 aa8.53□□□□□ -1.04
YKL063CYKL063C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.52□□□□□ -1.05not detected
YKL063CYKL063C SIS1P25294 352 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
YKL063CYKL063C WSC3Q12215 556 aa8.48□□□□□ -1.05
YKL063CYKL063C RCR1P38212 213 aa8.47□□□□□ -1.05
YKL063CYKL063C VPS29P38759 282 aa8.42□□□□□ -1.06
YKL063CYKL063C YFR006WP43590 535 aa8.42□□□□□ -1.06
YKL063CYKL063C VNX1P42839 908 aa8.41□□□□□ -1.06
YKL063CYKL063C RTG3P38165 486 aa8.39□□□□□ -1.07
YKL063CYKL063C GTT3P39996 337 aa8.38□□□□□ -1.07
YKL063CYKL063C DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
YKL063CYKL063C STS1P38637 319 aa8.35□□□□□ -1.07
YKL063CYKL063C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.34□□□□□ -1.07not detected
YKL063CYKL063C SPP1Q03012 353 aa8.33□□□□□ -1.08
YKL063CYKL063C TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
YKL063CYKL063C SET4P42948 560 aa8.23□□□□□ -1.09
YKL063CYKL063C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
YKL063CYKL063C YOL036WQ08206 761 aa8.2□□□□□ -1.1
YKL063CYKL063C ULI1P43604 169 aa8.19□□□□□ -1.1
YKL063CYKL063C RAM2P29703 316 aa8.18□□□□□ -1.1
YKL063CYKL063C LDB19Q12502 818 aa8.16□□□□□ -1.1
YKL063CYKL063C IOC2Q12072 812 aa8.15□□□□□ -1.1
YKL063CYKL063C TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YKL063CYKL063C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YKL063CYKL063C FKH1P40466 484 aa8.1□□□□□ -1.11
YKL063CYKL063C SAM3Q08986 587 aa8.1□□□□□ -1.11
YKL063CYKL063C MSB4Q12317 492 aa8.1□□□□□ -1.11
YKL063CYKL063C MIF2P35201 549 aa8.06□□□□□ -1.12
YKL063CYKL063C GYP5Q12344 894 aa8.05□□□□□ -1.12
YKL063CYKL063C MAK11P20484 414 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
YKL063CYKL063C DCW1P36091 449 aa8.04□□□□□ -1.12
YKL063CYKL063C EDS1P38073 919 aa8.04□□□□□ -1.12
YKL063CYKL063C RTG1P32607 177 aa8.03□□□□□ -1.12
YKL063CYKL063C EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
YKL063CYKL063C COQ8P27697 501 aa7.98□□□□□ -1.13
YKL063CYKL063C YJL171CP46992 396 aa7.98□□□□□ -1.13
YKL063CYKL063C PTC3P34221 468 aaKnown RBP7.96□□□□□ -1.14
YKL063CYKL063C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.95□□□□□ -1.14
YKL063CYKL063C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.94□□□□□ -1.14
YKL063CYKL063C HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.93□□□□□ -1.14
YKL063CYKL063C HTA2P04912 132 aa7.93□□□□□ -1.14
YKL063CYKL063C NCR1Q12200 1170 aa7.93□□□□□ -1.14
YKL063CYKL063C YEL023CP39992 682 aa7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.4 ms