RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W

DSE2, Transcript of Daughter cell-specific secreted protein with similarity to glucanases, yeastyeast

Gene DSE2, Length 978 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE2YHR143W TY1A-DR1Q03856 440 aa7.05□□□□□ -1.28
DSE2YHR143W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
DSE2YHR143W TY1A-BRQ12217 440 aa7.05□□□□□ -1.28
DSE2YHR143W TY1A-NL2Q12470 440 aa7.05□□□□□ -1.28
DSE2YHR143W TY1A-GR2Q12485 440 aa7.05□□□□□ -1.28
DSE2YHR143W DSF2P38213 736 aa7.04□□□□□ -1.28
DSE2YHR143W SEC2P17065 759 aa7.03□□□□□ -1.28
DSE2YHR143W MAM3Q12296 706 aa7.03□□□□□ -1.28
DSE2YHR143W NPL4P33755 580 aa7.02□□□□□ -1.29
DSE2YHR143W PSE1P32337 1089 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
DSE2YHR143W IES2P40154 320 aa7.01□□□□□ -1.29
DSE2YHR143W GCD11P32481 527 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
DSE2YHR143W YEL077CQ3E7X8 1277 aa7□□□□□ -1.29
DSE2YHR143W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
DSE2YHR143W NUP42P49686 430 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
DSE2YHR143W ERF2Q06551 359 aa6.97□□□□□ -1.29
DSE2YHR143W KEX2P13134 814 aa6.95□□□□□ -1.3
DSE2YHR143W CST6P40535 587 aa6.95□□□□□ -1.3
DSE2YHR143W ERG12P07277 443 aa6.94□□□□□ -1.3
DSE2YHR143W SPB4P25808 606 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
DSE2YHR143W RRN7P40992 514 aa6.93□□□□□ -1.3
DSE2YHR143W TRK1P12685 1235 aa6.92□□□□□ -1.3
DSE2YHR143W CLB5P30283 435 aa6.92□□□□□ -1.3
DSE2YHR143W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
DSE2YHR143W DIT2P21595 489 aa6.91□□□□□ -1.3
DSE2YHR143W LAM6Q08001 693 aa6.9□□□□□ -1.3
DSE2YHR143W CLA4P48562 842 aa6.88□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W AGE1Q04412 482 aa6.87□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W TEA1P47988 759 aa6.86□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W NIS1P53939 407 aa6.86□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W SIT4P20604 311 aa6.85□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W PAT1P25644 796 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W BDP1P46678 594 aa6.85□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W RTF1P53064 558 aa6.84□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W TUB4P53378 473 aa6.84□□□□□ -1.31
DSE2YHR143W YNL115CP53925 644 aa6.82□□□□□ -1.32
DSE2YHR143W MOD5P07884 428 aa6.81□□□□□ -1.32
DSE2YHR143W FPK1P53739 893 aa6.79□□□□□ -1.32
DSE2YHR143W CDC4P07834 779 aa6.75□□□□□ -1.33
DSE2YHR143W HED1Q03937 162 aa6.75□□□□□ -1.33
DSE2YHR143W YMR196WQ04336 1088 aa6.75□□□□□ -1.33
DSE2YHR143W BRE2P43132 505 aa6.74□□□□□ -1.33
DSE2YHR143W SLY41P22215 453 aa6.73□□□□□ -1.33
DSE2YHR143W GLC3P32775 704 aa6.73□□□□□ -1.33
DSE2YHR143W PUS5Q06244 254 aa6.73□□□□□ -1.33
DSE2YHR143W SCJ1P25303 377 aa6.72□□□□□ -1.33
DSE2YHR143W YNR021WP53723 404 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
DSE2YHR143W PDC1P06169 563 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W ATF2P53296 535 aa6.7□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W HST2P53686 357 aa6.7□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W MET32Q12041 191 aa6.7□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W KXD1P53158 218 aa6.69□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W TPD3P31383 635 aa6.68□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W HXT10P43581 546 aa6.67□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W TRM1P15565 570 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W GCR2Q01722 534 aa6.66□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W YDL206WQ12424 762 aa6.66□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W PUS6P53294 404 aa6.65□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W MMP1Q12372 583 aa6.65□□□□□ -1.34
DSE2YHR143W ESS1P22696 170 aa6.64□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W GLN1P32288 370 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W RPA14P50106 137 aa6.64□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W TBF1Q02457 562 aa6.64□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W LEU3P08638 886 aa6.63□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W ASH1P34233 588 aa6.63□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W AFT1P22149 690 aa6.62□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data6.62□□□□□ -1.35not detected
DSE2YHR143W YPR097WQ06839 1073 aa6.62□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W ALR1Q08269 859 aa6.62□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W AIM7Q12156 149 aa6.62□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W KTR1P27810 393 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W YJU3P28321 313 aa6.61□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W HST3P53687 447 aa6.59□□□□□ -1.35
DSE2YHR143W MET22P32179 357 aa6.58□□□□□ -1.36
DSE2YHR143W GAR1P28007 205 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
DSE2YHR143W RSC30P38781 883 aa6.56□□□□□ -1.36
DSE2YHR143W YJR115WP47152 169 aa6.55□□□□□ -1.36
DSE2YHR143W YPL062WQ02781 134 aa6.55□□□□□ -1.36
DSE2YHR143W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
DSE2YHR143W ENV9Q08651 330 aa6.55□□□□□ -1.36
DSE2YHR143W KIP2P28743 706 aa6.54□□□□□ -1.36
DSE2YHR143W IXR1P33417 597 aa6.53□□□□□ -1.36
DSE2YHR143W CSN12P47130 423 aa6.53□□□□□ -1.36
DSE2YHR143W MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
DSE2YHR143W YDR444WQ04093 687 aa6.52□□□□□ -1.37
DSE2YHR143W ARG8P18544 423 aa6.5□□□□□ -1.37
DSE2YHR143W VAC17P25591 423 aa6.5□□□□□ -1.37
DSE2YHR143W MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
DSE2YHR143W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
DSE2YHR143W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data6.49□□□□□ -1.37not detected
DSE2YHR143W KIN1P13185 1064 aa6.47□□□□□ -1.37
DSE2YHR143W UGA3P26370 528 aa6.47□□□□□ -1.37
DSE2YHR143W ITT1Q04638 464 aa6.47□□□□□ -1.37
DSE2YHR143W RAD59Q12223 238 aa6.47□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 12.9 ms