RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C SEC2P17065 759 aa6.55□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C HST3P53687 447 aa6.55□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-DR4O74302 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-AP0CX57 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-ORP0CX59 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-LR1P0CX68 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-MR2P0CX69 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-JR2P47099 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-DR1Q03856 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-BRQ12217 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-NL2Q12470 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C TY1A-GR2Q12485 440 aa6.54□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C MTC5Q03897 1148 aa6.53□□□□□ -1.36
GCN4YEL009C AFT1P22149 690 aa6.52□□□□□ -1.37
GCN4YEL009C ASH1P34233 588 aa6.52□□□□□ -1.37
GCN4YEL009C REF2P42073 533 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
GCN4YEL009C YDL176WQ12027 708 aa6.49□□□□□ -1.37
GCN4YEL009C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GCN4YEL009C ORC6P38826 435 aa6.48□□□□□ -1.37
GCN4YEL009C MVP1P40959 511 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
GCN4YEL009C RRD1P40454 393 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
GCN4YEL009C YPR109WQ06104 294 aa6.44□□□□□ -1.38
GCN4YEL009C MET32Q12041 191 aa6.43□□□□□ -1.38
GCN4YEL009C COX6P00427 148 aa6.41□□□□□ -1.38
GCN4YEL009C YLR346CQ06139 101 aa6.4□□□□□ -1.38
GCN4YEL009C RGR1P19263 1082 aa6.39□□□□□ -1.39
GCN4YEL009C YJR115WP47152 169 aa6.39□□□□□ -1.39
GCN4YEL009C MOD5P07884 428 aa6.38□□□□□ -1.39
GCN4YEL009C KEX2P13134 814 aa6.36□□□□□ -1.39
GCN4YEL009C MSB3P48566 633 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
GCN4YEL009C YPR148CQ06523 435 aa6.36□□□□□ -1.39
GCN4YEL009C ACO2P39533 789 aa6.35□□□□□ -1.39
GCN4YEL009C TRK2P28584 889 aa6.34□□□□□ -1.39
GCN4YEL009C PAC1P39946 494 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C CAF120P53836 1060 aa6.33□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C SRF1Q12516 437 aa6.33□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C CLB5P30283 435 aa6.32□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C PUS5Q06244 254 aa6.32□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C RTF1P53064 558 aa6.31□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C YGR035CP53222 116 aa6.31□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C SYH1Q02875 849 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C UGA3P26370 528 aa6.3□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C KXD1P53158 218 aa6.3□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C TUB4P53378 473 aa6.3□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C RTT106P40161 455 aa6.29□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C ERF2Q06551 359 aa6.28□□□□□ -1.4
GCN4YEL009C TPD3P31383 635 aa6.26□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C OPT2Q06593 877 aa6.26□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C AGE1Q04412 482 aa6.25□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C PTK2P47116 818 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C VPS70P47161 811 aa6.24□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C YPR204WQ08995 1032 aa6.24□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C GLY1P37303 387 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C YNL115CP53925 644 aa6.23□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C HXT10P43581 546 aa6.22□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C SCW11P53189 542 aa6.22□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C TYW1Q08960 810 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
GCN4YEL009C ICP55P40051 511 aa6.21□□□□□ -1.42
GCN4YEL009C NUP85P46673 744 aa6.21□□□□□ -1.42
GCN4YEL009C MIP1P15801 1254 aa6.19□□□□□ -1.42
GCN4YEL009C HPF1Q05164 967 aa6.19□□□□□ -1.42
GCN4YEL009C PUS1Q12211 544 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
GCN4YEL009C KIP2P28743 706 aa6.17□□□□□ -1.42
GCN4YEL009C YIR007WP40566 764 aa6.15□□□□□ -1.42
GCN4YEL009C UBP2Q01476 1272 aa6.15□□□□□ -1.42
GCN4YEL009C TY1A-BLQ12266 440 aa6.14□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C SIT4P20604 311 aa6.13□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C ALR1Q08269 859 aa6.13□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C DPH6Q12429 685 aa6.13□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C CKB1P43639 278 aa6.12□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C PDC1P06169 563 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C MRT4P33201 236 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C IXR1P33417 597 aa6.11□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C LSB3P43603 459 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C LSC2P53312 427 aa6.11□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C PHM7Q12252 991 aa6.11□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C TEA1P47988 759 aa6.1□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C ARG82P07250 355 aa6.09□□□□□ -1.43
GCN4YEL009C PBS2P08018 668 aa6.08□□□□□ -1.44
GCN4YEL009C RPA14P50106 137 aa6.08□□□□□ -1.44
GCN4YEL009C TBF1Q02457 562 aa6.08□□□□□ -1.44
GCN4YEL009C YPR097WQ06839 1073 aa6.05□□□□□ -1.44
GCN4YEL009C SLY41P22215 453 aa6.04□□□□□ -1.44
GCN4YEL009C LYS5P50113 272 aa6.04□□□□□ -1.44
GCN4YEL009C PUS6P53294 404 aa6.04□□□□□ -1.44
GCN4YEL009C MAM3Q12296 706 aa6.04□□□□□ -1.44
GCN4YEL009C YMR196WQ04336 1088 aa6.02□□□□□ -1.45
GCN4YEL009C AAD14P42884 376 aa6.01□□□□□ -1.45
GCN4YEL009C NIS1P53939 407 aa6□□□□□ -1.45
GCN4YEL009C YDL206WQ12424 762 aa6□□□□□ -1.45
GCN4YEL009C ROG3P43602 733 aa5.99□□□□□ -1.45
GCN4YEL009C NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data5.99□□□□□ -1.45not detected
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