RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C MTC1P47018 478 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
GCN4YEL009C FAP1P53971 965 aa13.19□□□□□ -0.3
GCN4YEL009C PRY3P47033 881 aa12.38□□□□□ -0.43
GCN4YEL009C AAD16Q02895 342 aa11.92□□□□□ -0.5
GCN4YEL009C PRI1P10363 409 aa11.82□□□□□ -0.52
GCN4YEL009C HAA1Q12753 694 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
GCN4YEL009C DRS1P32892 752 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
GCN4YEL009C YCK3P39962 524 aa11.44□□□□□ -0.58
GCN4YEL009C ISW2Q08773 1120 aa11.42□□□□□ -0.58
GCN4YEL009C RPG1P38249 964 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
GCN4YEL009C TSR3Q12094 313 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
GCN4YEL009C MRPL32P25348 183 aa10.79□□□□□ -0.68
GCN4YEL009C YGL015CP33199 130 aa10.65□□□□□ -0.7
GCN4YEL009C DIP2Q12220 943 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
GCN4YEL009C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
GCN4YEL009C REB1P21538 810 aa10.24□□□□□ -0.77
GCN4YEL009C BUD31P25337 157 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
GCN4YEL009C RPL17AP05740 184 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
GCN4YEL009C RPL17BP46990 184 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
GCN4YEL009C UBP10P53874 792 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
GCN4YEL009C CDC27P38042 758 aa9.88□□□□□ -0.83
GCN4YEL009C AVT3P36062 692 aa9.76□□□□□ -0.85
GCN4YEL009C MAP2P38174 421 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
GCN4YEL009C YKR023WP36119 530 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
GCN4YEL009C TIF4632P39936 914 aaKnown RBP9.61□□□□□ -0.87
GCN4YEL009C UBP9P39967 754 aa9.61□□□□□ -0.87
GCN4YEL009C SIS1P25294 352 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
GCN4YEL009C SPT21P35209 758 aa9.53□□□□□ -0.88
GCN4YEL009C TGL3P40308 642 aa9.51□□□□□ -0.89
GCN4YEL009C TFC8Q12308 588 aa9.5□□□□□ -0.89
GCN4YEL009C HOP09932 586 aa9.45□□□□□ -0.9
GCN4YEL009C SLX5P32828 619 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
GCN4YEL009C SCY1P53009 804 aa9.4□□□□□ -0.9
GCN4YEL009C DCD1P06773 312 aa9.38□□□□□ -0.91
GCN4YEL009C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
GCN4YEL009C BCH2P36122 765 aa9.14□□□□□ -0.95
GCN4YEL009C RIM101P33400 625 aa9.04□□□□□ -0.96
GCN4YEL009C MST1P07236 462 aa8.95□□□□□ -0.98
GCN4YEL009C YOR238WQ08634 303 aa8.93□□□□□ -0.98
GCN4YEL009C YBL029C-AQ3E756 94 aa8.9□□□□□ -0.98
GCN4YEL009C EPS1P40557 701 aa8.85□□□□□ -0.99
GCN4YEL009C BDF1P35817 686 aa8.84□□□□□ -0.99
GCN4YEL009C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data8.81□□□□□ -1not detected
GCN4YEL009C VNX1P42839 908 aa8.81□□□□□ -1
GCN4YEL009C SPP1Q03012 353 aa8.77□□□□□ -1.01
GCN4YEL009C YJL171CP46992 396 aa8.76□□□□□ -1.01
GCN4YEL009C YAP5P40574 245 aa8.73□□□□□ -1.01
GCN4YEL009C YIL055CP40523 627 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
GCN4YEL009C PTP3P40048 928 aa8.68□□□□□ -1.02
GCN4YEL009C BBC1P47068 1157 aa8.68□□□□□ -1.02
GCN4YEL009C OXP1P28273 1286 aa8.63□□□□□ -1.03
GCN4YEL009C WSC3Q12215 556 aa8.63□□□□□ -1.03
GCN4YEL009C TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GCN4YEL009C AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
GCN4YEL009C GTT3P39996 337 aa8.59□□□□□ -1.03
GCN4YEL009C FKH1P40466 484 aa8.59□□□□□ -1.03
GCN4YEL009C BMT6Q12291 365 aa8.51□□□□□ -1.05
GCN4YEL009C RSM7P47150 247 aa8.5□□□□□ -1.05
GCN4YEL009C AI2P03876 854 aa8.48□□□□□ -1.05
GCN4YEL009C LDB19Q12502 818 aa8.47□□□□□ -1.05
GCN4YEL009C ULI1P43604 169 aa8.45□□□□□ -1.06
GCN4YEL009C EAP1P36041 632 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
GCN4YEL009C IOC2Q12072 812 aa8.38□□□□□ -1.07
GCN4YEL009C MSB4Q12317 492 aa8.38□□□□□ -1.07
GCN4YEL009C YAH1Q12184 172 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
GCN4YEL009C NCR1Q12200 1170 aa8.26□□□□□ -1.09
GCN4YEL009C RTG1P32607 177 aa8.23□□□□□ -1.09
GCN4YEL009C SEC61P32915 480 aa8.21□□□□□ -1.1
GCN4YEL009C PIB1Q06651 286 aa8.21□□□□□ -1.1
GCN4YEL009C TFG1P41895 735 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
GCN4YEL009C YNL035CP53962 389 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
GCN4YEL009C TRP5P00931 707 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
GCN4YEL009C YOL036WQ08206 761 aa8.15□□□□□ -1.1
GCN4YEL009C SET4P42948 560 aa8.14□□□□□ -1.11
GCN4YEL009C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
GCN4YEL009C MRM1P25270 412 aa8.1□□□□□ -1.11
GCN4YEL009C YLR271WQ06152 274 aa8.1□□□□□ -1.11
GCN4YEL009C BCK2P33306 851 aa8.08□□□□□ -1.12
GCN4YEL009C YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.07□□□□□ -1.12not detected
GCN4YEL009C TFA1P36100 482 aa8.06□□□□□ -1.12
GCN4YEL009C CHL1P22516 861 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
GCN4YEL009C JIP4Q03361 876 aa8.03□□□□□ -1.12
GCN4YEL009C ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
GCN4YEL009C DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
GCN4YEL009C SAM3Q08986 587 aa8□□□□□ -1.13
GCN4YEL009C ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8□□□□□ -1.13not detected
GCN4YEL009C SAP30P38429 201 aa7.99□□□□□ -1.13
GCN4YEL009C VMA1P17255 1071 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
GCN4YEL009C YDL129WQ07555 291 aa7.98□□□□□ -1.13
GCN4YEL009C RTG3P38165 486 aa7.96□□□□□ -1.14
GCN4YEL009C PRE3P38624 215 aa7.94□□□□□ -1.14
GCN4YEL009C DAN4P47179 1161 aa7.93□□□□□ -1.14
GCN4YEL009C VPS29P38759 282 aa7.91□□□□□ -1.14
GCN4YEL009C YFR006WP43590 535 aa7.89□□□□□ -1.15
GCN4YEL009C HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
GCN4YEL009C HTA2P04912 132 aa7.88□□□□□ -1.15
GCN4YEL009C PTC4P38089 393 aa7.87□□□□□ -1.15
GCN4YEL009C GYP5Q12344 894 aa7.87□□□□□ -1.15
GCN4YEL009C XDJ1P39102 459 aa7.86□□□□□ -1.15
GCN4YEL009C STS1P38637 319 aa7.84□□□□□ -1.15
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