RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm11011D3Z3L9 86 aa10.46□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rbm3O89086 153 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10308Q9CVR5 141 aa10.46□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 A930002H24RikQ8C8Y3 163 aa10.44□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv1-122A0A140T8M9 119 aa10.44□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa10.44□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem243B2RVB9 118 aa10.43□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Phf5aP83870 110 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Defb37Q7TMD2 62 aa10.43□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem254aP0DN89 123 aa10.42□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem254bP0DN90 123 aa10.42□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem254cP0DN91 123 aa10.42□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vpreb2P13373 142 aa10.41□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 A730071L15RikQ8C4X0 137 aa10.41□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv8-21A0A140T8P7 120 aa10.4□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sfta2E9PXB6 77 aa10.4□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ubl5Q9EPV8 73 aa10.4□□□□□ -0.74
Nisch-221ENSMUST00000171735 Adm2Q7TNK8 150 aa10.39□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 A830005F24RikQ8BRT5 167 aa10.39□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tnp2P11378 117 aa10.38□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 A330070K13RikQ8CA53 115 aa10.38□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dnah8Q91XQ0 4731 aa10.37□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 NbdyA0A0N4SUI7 68 aa10.37□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv8-28A0A0G2JE47 121 aa10.36□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ube2bP63147 152 aa10.36□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vps13bQ80TY5 3993 aa10.35□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 A0A286YE02 88 aa10.34□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sprr2jO70561 109 aa10.34□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igf1P05017 153 aa10.34□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 Defa7P50705 93 aa10.34□□□□□ -0.75
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm37389A0A0A6YW05 95 aa10.32□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vpreb3D3Z6J4 130 aa10.32□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 6030445D17RikE9Q8F9 148 aa10.32□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cox6a2P43023 97 aa10.32□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lrp1bQ9JI18 4599 aa10.32□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm17521F6QAC8 156 aa10.31□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap14O08640 167 aa10.31□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vpreb1P13372 142 aa10.31□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hectd4E9Q2E4 4418 aa10.3□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 P06320 134 aa10.3□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 4930535I16RikQ9CUI2 172 aa10.3□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Wfdc10Q3V2J9 124 aa10.29□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm12353A2AGJ4 60 aa10.29□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10401E9Q3K6 71 aa10.29□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 Herc2Q4U2R1 4836 aa10.28□□□□□ -0.76
Nisch-221ENSMUST00000171735 AI606181Q8C7B9 129 aa10.27□□□□□ -0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa10.26□□□□□ -0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10570F6VB42 170 aa10.26□□□□□ -0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10139O88245 57 aa10.26□□□□□ -0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 MplkipQ9D011 178 aa10.26□□□□□ -0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Q8K1L6 76 aa10.25□□□□□ -0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rpl37aP61514 92 aa10.24□□□□□ -0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 D130052B06RikQ3UW13 202 aa10.24□□□□□ -0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm10642Q3TWM1 71 aa10.22□□□□□ -0.77
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fam19a3Q7TPG6 132 aa10.21□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 RetnlbQ99P86 105 aa10.21□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prr13Q9CQJ5 137 aa10.21□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 HrnrQ8VHD8 2496 aa10.21□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Birc6O88738 4882 aa10.2□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fat2Q5F226 4351 aa10.19□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm17689B3GLJ4 109 aa10.18□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Defa28D3Z1V9 94 aa10.18□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm37013Q8K491 104 aa10.18□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Abca13Q5SSE9 5034 aa10.17□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Chchd10Q7TNL9 138 aa10.17□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cystm1Q8K353 104 aa10.17□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ndufc1Q9CQY9 76 aa10.16□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ube2aQ9Z255 152 aa10.16□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv3-4A0A140T8Q4 119 aa10.16□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm27235Q3UW50 83 aa10.16□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa10.15□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa10.15□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 7530416G11RikJ3QJX6 159 aa10.15□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Krtap19-5O08632 62 aa10.15□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Defa25Q5G864 92 aa10.15□□□□□ -0.78
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa10.12□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Serp2Q6TAW2 65 aa10.12□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mrpl34Q99N91 92 aa10.12□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 1700018G05RikA0A1B0GSI2 66 aa10.11□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc179J3QM76 67 aa10.11□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Apoc4Q61268 124 aa10.11□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fat3Q8BNA6 4555 aa10.1□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 C130032M10RikQ8C888 123 aa10.1□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mrpl55Q9CZ83 127 aa10.1□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm20726G3UX18 150 aa10.09□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Wfdc13Q5DQQ6 81 aa10.09□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Odf3bQ5M8M2 238 aa10.09□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Defb39Q70KL3 74 aa10.09□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Q8BT88 171 aa10.09□□□□□ -0.79
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm44790A0A0N4SV91 103 aa10.08□□□□□ -0.8
Nisch-221ENSMUST00000171735 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa10.08□□□□□ -0.8
Nisch-221ENSMUST00000171735 UqcrqQ9CQ69 82 aa10.07□□□□□ -0.8
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv3-5A0A140T8M6 119 aa10.06□□□□□ -0.8
Nisch-221ENSMUST00000171735 Pcp4P63054 62 aa10.06□□□□□ -0.8
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv3-10A0A0G2JGN0 119 aa10.06□□□□□ -0.8
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm28539A0A087WSL9 92 aa10.04□□□□□ -0.8
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa10.04□□□□□ -0.8
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm28230A0A0A0MQ91 144 aa10.03□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 49.1 ms