Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sfta2E9PXB6 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Sfta2E9PXB6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sfta2E9PXB6 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sfta2E9PXB6 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sfta2E9PXB6 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sfta2E9PXB6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sfta2E9PXB6 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sfta2E9PXB6 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sfta2E9PXB6 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Sfta2E9PXB6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sfta2E9PXB6 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Sfta2E9PXB6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Sfta2E9PXB6 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Sfta2E9PXB6 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Sfta2E9PXB6 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Sfta2E9PXB6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Sfta2E9PXB6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sfta2E9PXB6 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sfta2E9PXB6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sfta2E9PXB6 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sfta2E9PXB6 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sfta2E9PXB6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sfta2E9PXB6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sfta2E9PXB6 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Sfta2E9PXB6 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Sfta2E9PXB6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Sfta2E9PXB6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfta2E9PXB6 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Sfta2E9PXB6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sfta2E9PXB6 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Sfta2E9PXB6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Sfta2E9PXB6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Sfta2E9PXB6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Sfta2E9PXB6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfta2E9PXB6 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Sfta2E9PXB6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Sfta2E9PXB6 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Sfta2E9PXB6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sfta2E9PXB6 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sfta2E9PXB6 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sfta2E9PXB6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sfta2E9PXB6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sfta2E9PXB6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sfta2E9PXB6 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sfta2E9PXB6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sfta2E9PXB6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sfta2E9PXB6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfta2E9PXB6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfta2E9PXB6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfta2E9PXB6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sfta2E9PXB6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sfta2E9PXB6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sfta2E9PXB6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfta2E9PXB6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sfta2E9PXB6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sfta2E9PXB6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sfta2E9PXB6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sfta2E9PXB6 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfta2E9PXB6 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sfta2E9PXB6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfta2E9PXB6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfta2E9PXB6 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Sfta2E9PXB6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Sfta2E9PXB6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Sfta2E9PXB6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sfta2E9PXB6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfta2E9PXB6 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfta2E9PXB6 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfta2E9PXB6 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sfta2E9PXB6 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfta2E9PXB6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sfta2E9PXB6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfta2E9PXB6 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sfta2E9PXB6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfta2E9PXB6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfta2E9PXB6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sfta2E9PXB6 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sfta2E9PXB6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfta2E9PXB6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sfta2E9PXB6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfta2E9PXB6 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfta2E9PXB6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfta2E9PXB6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sfta2E9PXB6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sfta2E9PXB6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sfta2E9PXB6 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfta2E9PXB6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sfta2E9PXB6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Sfta2E9PXB6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sfta2E9PXB6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfta2E9PXB6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Sfta2E9PXB6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfta2E9PXB6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfta2E9PXB6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfta2E9PXB6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sfta2E9PXB6 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Sfta2E9PXB6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sfta2E9PXB6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sfta2E9PXB6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms