Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ69

Uqcrq, Cytochrome b-c1 complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UqcrqQ9CQ69 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
UqcrqQ9CQ69 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
UqcrqQ9CQ69 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UqcrqQ9CQ69 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
UqcrqQ9CQ69 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
UqcrqQ9CQ69 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
UqcrqQ9CQ69 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UqcrqQ9CQ69 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
UqcrqQ9CQ69 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
UqcrqQ9CQ69 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
UqcrqQ9CQ69 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
UqcrqQ9CQ69 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UqcrqQ9CQ69 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
UqcrqQ9CQ69 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
UqcrqQ9CQ69 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
UqcrqQ9CQ69 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
UqcrqQ9CQ69 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UqcrqQ9CQ69 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
UqcrqQ9CQ69 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
UqcrqQ9CQ69 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UqcrqQ9CQ69 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
UqcrqQ9CQ69 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
UqcrqQ9CQ69 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
UqcrqQ9CQ69 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UqcrqQ9CQ69 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UqcrqQ9CQ69 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UqcrqQ9CQ69 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UqcrqQ9CQ69 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UqcrqQ9CQ69 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UqcrqQ9CQ69 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
UqcrqQ9CQ69 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UqcrqQ9CQ69 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
UqcrqQ9CQ69 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UqcrqQ9CQ69 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
UqcrqQ9CQ69 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UqcrqQ9CQ69 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
UqcrqQ9CQ69 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
UqcrqQ9CQ69 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UqcrqQ9CQ69 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
UqcrqQ9CQ69 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UqcrqQ9CQ69 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
UqcrqQ9CQ69 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
UqcrqQ9CQ69 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UqcrqQ9CQ69 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
UqcrqQ9CQ69 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UqcrqQ9CQ69 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
UqcrqQ9CQ69 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UqcrqQ9CQ69 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UqcrqQ9CQ69 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UqcrqQ9CQ69 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UqcrqQ9CQ69 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
UqcrqQ9CQ69 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
UqcrqQ9CQ69 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
UqcrqQ9CQ69 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
UqcrqQ9CQ69 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
UqcrqQ9CQ69 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UqcrqQ9CQ69 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
UqcrqQ9CQ69 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UqcrqQ9CQ69 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UqcrqQ9CQ69 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
UqcrqQ9CQ69 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
UqcrqQ9CQ69 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
UqcrqQ9CQ69 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
UqcrqQ9CQ69 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
UqcrqQ9CQ69 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UqcrqQ9CQ69 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
UqcrqQ9CQ69 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
UqcrqQ9CQ69 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
UqcrqQ9CQ69 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
UqcrqQ9CQ69 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
UqcrqQ9CQ69 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UqcrqQ9CQ69 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UqcrqQ9CQ69 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UqcrqQ9CQ69 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UqcrqQ9CQ69 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UqcrqQ9CQ69 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UqcrqQ9CQ69 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
UqcrqQ9CQ69 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UqcrqQ9CQ69 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UqcrqQ9CQ69 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
UqcrqQ9CQ69 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
UqcrqQ9CQ69 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
UqcrqQ9CQ69 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UqcrqQ9CQ69 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UqcrqQ9CQ69 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
UqcrqQ9CQ69 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
UqcrqQ9CQ69 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
UqcrqQ9CQ69 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
UqcrqQ9CQ69 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UqcrqQ9CQ69 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UqcrqQ9CQ69 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
UqcrqQ9CQ69 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UqcrqQ9CQ69 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
UqcrqQ9CQ69 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
UqcrqQ9CQ69 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
UqcrqQ9CQ69 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
UqcrqQ9CQ69 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
UqcrqQ9CQ69 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
UqcrqQ9CQ69 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
UqcrqQ9CQ69 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms