Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB9

Tmem243, MCG1490, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem243B2RVB9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tmem243B2RVB9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Tmem243B2RVB9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Tmem243B2RVB9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tmem243B2RVB9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tmem243B2RVB9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem243B2RVB9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem243B2RVB9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem243B2RVB9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Tmem243B2RVB9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Tmem243B2RVB9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Tmem243B2RVB9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Tmem243B2RVB9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Tmem243B2RVB9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Tmem243B2RVB9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Tmem243B2RVB9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem243B2RVB9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem243B2RVB9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem243B2RVB9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Tmem243B2RVB9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem243B2RVB9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Tmem243B2RVB9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Tmem243B2RVB9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Tmem243B2RVB9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem243B2RVB9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem243B2RVB9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tmem243B2RVB9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tmem243B2RVB9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tmem243B2RVB9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tmem243B2RVB9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tmem243B2RVB9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem243B2RVB9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem243B2RVB9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem243B2RVB9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem243B2RVB9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Tmem243B2RVB9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Tmem243B2RVB9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem243B2RVB9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem243B2RVB9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem243B2RVB9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem243B2RVB9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tmem243B2RVB9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem243B2RVB9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem243B2RVB9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem243B2RVB9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem243B2RVB9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem243B2RVB9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem243B2RVB9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem243B2RVB9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem243B2RVB9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Tmem243B2RVB9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem243B2RVB9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem243B2RVB9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem243B2RVB9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmem243B2RVB9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem243B2RVB9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem243B2RVB9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem243B2RVB9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem243B2RVB9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem243B2RVB9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem243B2RVB9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem243B2RVB9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem243B2RVB9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem243B2RVB9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem243B2RVB9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmem243B2RVB9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem243B2RVB9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Tmem243B2RVB9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tmem243B2RVB9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem243B2RVB9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem243B2RVB9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem243B2RVB9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem243B2RVB9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem243B2RVB9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem243B2RVB9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem243B2RVB9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem243B2RVB9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem243B2RVB9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem243B2RVB9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem243B2RVB9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tmem243B2RVB9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tmem243B2RVB9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Tmem243B2RVB9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem243B2RVB9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem243B2RVB9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem243B2RVB9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tmem243B2RVB9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem243B2RVB9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem243B2RVB9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem243B2RVB9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem243B2RVB9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem243B2RVB9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tmem243B2RVB9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem243B2RVB9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem243B2RVB9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem243B2RVB9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tmem243B2RVB9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem243B2RVB9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem243B2RVB9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem243B2RVB9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms