Protein–RNA interactions for Protein: P06320

T-cell receptor beta chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06320 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P06320 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
P06320 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P06320 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
P06320 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P06320 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
P06320 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
P06320 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
P06320 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
P06320 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
P06320 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06320 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P06320 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P06320 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P06320 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P06320 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
P06320 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
P06320 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P06320 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
P06320 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
P06320 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06320 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06320 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P06320 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P06320 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P06320 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P06320 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P06320 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P06320 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P06320 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P06320 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P06320 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
P06320 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P06320 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P06320 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P06320 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P06320 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06320 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P06320 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P06320 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P06320 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06320 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06320 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06320 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06320 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
P06320 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06320 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06320 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P06320 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P06320 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P06320 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P06320 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P06320 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P06320 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P06320 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P06320 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P06320 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P06320 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P06320 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P06320 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P06320 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
P06320 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
P06320 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
P06320 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
P06320 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
P06320 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06320 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06320 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
P06320 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
P06320 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
P06320 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
P06320 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
P06320 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
P06320 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
P06320 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
P06320 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
P06320 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
P06320 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P06320 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
P06320 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
P06320 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
P06320 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
P06320 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
P06320 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P06320 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
P06320 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06320 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
P06320 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
P06320 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
P06320 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P06320 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
P06320 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06320 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
P06320 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
P06320 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P06320 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
P06320 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P06320 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
P06320 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
P06320 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms