Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1V9

Defa28, Defensin, alpha, 28, mousemouse

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa28D3Z1V9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa28D3Z1V9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Defa28D3Z1V9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Defa28D3Z1V9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Defa28D3Z1V9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Defa28D3Z1V9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Defa28D3Z1V9 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Defa28D3Z1V9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Defa28D3Z1V9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Defa28D3Z1V9 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Defa28D3Z1V9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Defa28D3Z1V9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Defa28D3Z1V9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Defa28D3Z1V9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Defa28D3Z1V9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Defa28D3Z1V9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Defa28D3Z1V9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Defa28D3Z1V9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Defa28D3Z1V9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Defa28D3Z1V9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Defa28D3Z1V9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Defa28D3Z1V9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Defa28D3Z1V9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Defa28D3Z1V9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Defa28D3Z1V9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Defa28D3Z1V9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Defa28D3Z1V9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Defa28D3Z1V9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Defa28D3Z1V9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Defa28D3Z1V9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Defa28D3Z1V9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Defa28D3Z1V9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Defa28D3Z1V9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Defa28D3Z1V9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Defa28D3Z1V9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Defa28D3Z1V9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Defa28D3Z1V9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Defa28D3Z1V9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Defa28D3Z1V9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Defa28D3Z1V9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa28D3Z1V9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa28D3Z1V9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Defa28D3Z1V9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Defa28D3Z1V9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Defa28D3Z1V9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Defa28D3Z1V9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Defa28D3Z1V9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Defa28D3Z1V9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa28D3Z1V9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa28D3Z1V9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa28D3Z1V9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa28D3Z1V9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa28D3Z1V9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa28D3Z1V9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Defa28D3Z1V9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa28D3Z1V9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Defa28D3Z1V9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Defa28D3Z1V9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Defa28D3Z1V9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Defa28D3Z1V9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa28D3Z1V9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa28D3Z1V9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Defa28D3Z1V9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa28D3Z1V9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Defa28D3Z1V9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa28D3Z1V9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Defa28D3Z1V9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa28D3Z1V9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Defa28D3Z1V9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Defa28D3Z1V9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Defa28D3Z1V9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Defa28D3Z1V9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa28D3Z1V9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Defa28D3Z1V9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Defa28D3Z1V9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa28D3Z1V9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Defa28D3Z1V9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Defa28D3Z1V9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Defa28D3Z1V9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Defa28D3Z1V9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa28D3Z1V9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Defa28D3Z1V9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Defa28D3Z1V9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Defa28D3Z1V9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa28D3Z1V9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Defa28D3Z1V9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa28D3Z1V9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Defa28D3Z1V9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa28D3Z1V9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa28D3Z1V9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Defa28D3Z1V9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa28D3Z1V9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa28D3Z1V9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Defa28D3Z1V9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa28D3Z1V9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Defa28D3Z1V9 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Defa28D3Z1V9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Defa28D3Z1V9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa28D3Z1V9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Defa28D3Z1V9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms