Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Vpreb1P13372 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Vpreb1P13372 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vpreb1P13372 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vpreb1P13372 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Vpreb1P13372 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Vpreb1P13372 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Vpreb1P13372 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Vpreb1P13372 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Vpreb1P13372 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Vpreb1P13372 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Vpreb1P13372 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Vpreb1P13372 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Vpreb1P13372 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Vpreb1P13372 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Vpreb1P13372 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Vpreb1P13372 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vpreb1P13372 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Vpreb1P13372 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Vpreb1P13372 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Vpreb1P13372 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Vpreb1P13372 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vpreb1P13372 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vpreb1P13372 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Vpreb1P13372 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Vpreb1P13372 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Vpreb1P13372 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Vpreb1P13372 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Vpreb1P13372 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Vpreb1P13372 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vpreb1P13372 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Vpreb1P13372 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vpreb1P13372 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vpreb1P13372 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vpreb1P13372 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vpreb1P13372 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vpreb1P13372 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vpreb1P13372 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vpreb1P13372 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vpreb1P13372 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vpreb1P13372 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vpreb1P13372 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vpreb1P13372 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vpreb1P13372 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vpreb1P13372 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vpreb1P13372 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vpreb1P13372 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vpreb1P13372 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Vpreb1P13372 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vpreb1P13372 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vpreb1P13372 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vpreb1P13372 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vpreb1P13372 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vpreb1P13372 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vpreb1P13372 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Vpreb1P13372 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vpreb1P13372 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Vpreb1P13372 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vpreb1P13372 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vpreb1P13372 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Vpreb1P13372 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Vpreb1P13372 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Vpreb1P13372 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vpreb1P13372 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Vpreb1P13372 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vpreb1P13372 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Vpreb1P13372 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Vpreb1P13372 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Vpreb1P13372 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Vpreb1P13372 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Vpreb1P13372 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vpreb1P13372 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Vpreb1P13372 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Vpreb1P13372 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vpreb1P13372 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vpreb1P13372 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Vpreb1P13372 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Vpreb1P13372 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Vpreb1P13372 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Vpreb1P13372 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Vpreb1P13372 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Vpreb1P13372 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vpreb1P13372 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vpreb1P13372 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vpreb1P13372 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vpreb1P13372 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vpreb1P13372 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Vpreb1P13372 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Vpreb1P13372 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Vpreb1P13372 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vpreb1P13372 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vpreb1P13372 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vpreb1P13372 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vpreb1P13372 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vpreb1P13372 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Vpreb1P13372 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vpreb1P13372 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vpreb1P13372 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vpreb1P13372 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vpreb1P13372 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms