Protein–RNA interactions for Protein: P0DN89

Tmem254a, Transmembrane protein 254, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254aP0DN89 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem254aP0DN89 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem254aP0DN89 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Tmem254aP0DN89 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem254aP0DN89 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem254aP0DN89 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem254aP0DN89 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Tmem254aP0DN89 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Tmem254aP0DN89 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Tmem254aP0DN89 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Tmem254aP0DN89 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Tmem254aP0DN89 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Tmem254aP0DN89 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tmem254aP0DN89 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tmem254aP0DN89 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Tmem254aP0DN89 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Tmem254aP0DN89 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Tmem254aP0DN89 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Tmem254aP0DN89 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Tmem254aP0DN89 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Tmem254aP0DN89 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tmem254aP0DN89 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tmem254aP0DN89 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tmem254aP0DN89 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem254aP0DN89 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Tmem254aP0DN89 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tmem254aP0DN89 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem254aP0DN89 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem254aP0DN89 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem254aP0DN89 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem254aP0DN89 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem254aP0DN89 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tmem254aP0DN89 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tmem254aP0DN89 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tmem254aP0DN89 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem254aP0DN89 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem254aP0DN89 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem254aP0DN89 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem254aP0DN89 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem254aP0DN89 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem254aP0DN89 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem254aP0DN89 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem254aP0DN89 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem254aP0DN89 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Tmem254aP0DN89 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem254aP0DN89 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tmem254aP0DN89 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tmem254aP0DN89 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tmem254aP0DN89 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem254aP0DN89 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tmem254aP0DN89 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tmem254aP0DN89 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem254aP0DN89 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem254aP0DN89 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem254aP0DN89 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem254aP0DN89 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem254aP0DN89 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem254aP0DN89 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tmem254aP0DN89 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Tmem254aP0DN89 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tmem254aP0DN89 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tmem254aP0DN89 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tmem254aP0DN89 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tmem254aP0DN89 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tmem254aP0DN89 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem254aP0DN89 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem254aP0DN89 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tmem254aP0DN89 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem254aP0DN89 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tmem254aP0DN89 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tmem254aP0DN89 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Tmem254aP0DN89 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem254aP0DN89 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Tmem254aP0DN89 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Tmem254aP0DN89 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Tmem254aP0DN89 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Tmem254aP0DN89 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tmem254aP0DN89 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem254aP0DN89 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tmem254aP0DN89 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem254aP0DN89 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Tmem254aP0DN89 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem254aP0DN89 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Tmem254aP0DN89 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Tmem254aP0DN89 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Tmem254aP0DN89 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tmem254aP0DN89 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tmem254aP0DN89 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem254aP0DN89 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmem254aP0DN89 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmem254aP0DN89 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmem254aP0DN89 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmem254aP0DN89 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Tmem254aP0DN89 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Tmem254aP0DN89 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tmem254aP0DN89 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms